Protein–RNA interactions for Protein: D3YU50

Mybpc1, Myosin-binding protein C, slow-type, mousemouse

Predictions only

Length 1,127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mybpc1D3YU50 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mybpc1D3YU50 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms