Protein–RNA interactions for Protein: C0HKC9

Smok3b, Sperm motility kinase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok3bC0HKC9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smok3bC0HKC9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smok3bC0HKC9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smok3bC0HKC9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smok3bC0HKC9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smok3bC0HKC9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smok3bC0HKC9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smok3bC0HKC9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smok3bC0HKC9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smok3bC0HKC9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smok3bC0HKC9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smok3bC0HKC9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smok3bC0HKC9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smok3bC0HKC9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smok3bC0HKC9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smok3bC0HKC9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smok3bC0HKC9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Smok3bC0HKC9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smok3bC0HKC9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Smok3bC0HKC9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smok3bC0HKC9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smok3bC0HKC9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Smok3bC0HKC9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smok3bC0HKC9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smok3bC0HKC9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smok3bC0HKC9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smok3bC0HKC9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Smok3bC0HKC9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smok3bC0HKC9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smok3bC0HKC9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smok3bC0HKC9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smok3bC0HKC9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smok3bC0HKC9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smok3bC0HKC9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms