Protein–RNA interactions for Protein: B1B0V2

AU022751, Expressed sequence AU022751, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU022751B1B0V2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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AU022751B1B0V2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
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AU022751B1B0V2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AU022751B1B0V2 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
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AU022751B1B0V2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms