Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms