Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms