Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms