Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms