Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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