Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms