Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms