Protein–RNA interactions for Protein: A2RTT5

Vmn1r232, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r232A2RTT5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Vmn1r232A2RTT5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r232A2RTT5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r232A2RTT5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms