Protein–RNA interactions for Protein: A2AMT6

Vmn1r2, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r2A2AMT6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r2A2AMT6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r2A2AMT6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r2A2AMT6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r2A2AMT6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r2A2AMT6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r2A2AMT6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r2A2AMT6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r2A2AMT6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r2A2AMT6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r2A2AMT6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r2A2AMT6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r2A2AMT6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r2A2AMT6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r2A2AMT6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r2A2AMT6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r2A2AMT6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r2A2AMT6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r2A2AMT6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r2A2AMT6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r2A2AMT6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r2A2AMT6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r2A2AMT6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r2A2AMT6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r2A2AMT6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r2A2AMT6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r2A2AMT6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r2A2AMT6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r2A2AMT6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r2A2AMT6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r2A2AMT6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r2A2AMT6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r2A2AMT6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r2A2AMT6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r2A2AMT6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r2A2AMT6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r2A2AMT6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r2A2AMT6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r2A2AMT6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r2A2AMT6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r2A2AMT6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r2A2AMT6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r2A2AMT6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r2A2AMT6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r2A2AMT6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r2A2AMT6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r2A2AMT6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r2A2AMT6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r2A2AMT6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r2A2AMT6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r2A2AMT6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r2A2AMT6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r2A2AMT6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r2A2AMT6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms