Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms