Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms