Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ90

SPG7, Paraplegin, humanhuman

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Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG7Q9UQ90 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SPG7Q9UQ90 RNA5SP106-201ENST00000517274 100 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SPG7Q9UQ90 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-1.47□□□□□ -2.64
SPG7Q9UQ90 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SPG7Q9UQ90 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SPG7Q9UQ90 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SPG7Q9UQ90 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SPG7Q9UQ90 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SPG7Q9UQ90 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SPG7Q9UQ90 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SPG7Q9UQ90 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SPG7Q9UQ90 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SPG7Q9UQ90 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SPG7Q9UQ90 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SPG7Q9UQ90 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SPG7Q9UQ90 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SPG7Q9UQ90 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SPG7Q9UQ90 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SPG7Q9UQ90 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SPG7Q9UQ90 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SPG7Q9UQ90 MIR509-1-201ENST00000385265 94 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
SPG7Q9UQ90 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
SPG7Q9UQ90 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
SPG7Q9UQ90 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SPG7Q9UQ90 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SPG7Q9UQ90 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SPG7Q9UQ90 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SPG7Q9UQ90 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SPG7Q9UQ90 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SPG7Q9UQ90 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SPG7Q9UQ90 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SPG7Q9UQ90 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SPG7Q9UQ90 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
SPG7Q9UQ90 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
SPG7Q9UQ90 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1.83□□□□□ -2.7
SPG7Q9UQ90 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
SPG7Q9UQ90 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
SPG7Q9UQ90 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.79-201ENST00000362992 113 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
SPG7Q9UQ90 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
SPG7Q9UQ90 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
SPG7Q9UQ90 MIR5693-201ENST00000577722 73 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
SPG7Q9UQ90 RNU6-59P-201ENST00000384787 107 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
SPG7Q9UQ90 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SPG7Q9UQ90 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
SPG7Q9UQ90 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SPG7Q9UQ90 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
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SPG7Q9UQ90 RNY4P13-201ENST00000384284 96 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.830-201ENST00000628531 96 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
SPG7Q9UQ90 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SPG7Q9UQ90 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
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SPG7Q9UQ90 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SPG7Q9UQ90 AL731768.1-201ENST00000603124 139 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
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SPG7Q9UQ90 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SPG7Q9UQ90 MIRLET7A3-201ENST00000362116 74 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SPG7Q9UQ90 MIR656-201ENST00000385224 78 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
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SPG7Q9UQ90 U6.103-201ENST00000637085 61 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.266-201ENST00000364678 96 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
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SPG7Q9UQ90 Y_RNA.663-201ENST00000516043 101 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.335-201ENST00000365299 96 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.652-201ENST00000458902 102 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
SPG7Q9UQ90 RNU6-854P-201ENST00000364036 107 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.612-201ENST00000410717 95 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
SPG7Q9UQ90 AL359920.1-201ENST00000618332 176 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
SPG7Q9UQ90 SNORD115-45-201ENST00000391078 81 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
SPG7Q9UQ90 MIR124-1-201ENST00000385275 85 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SPG7Q9UQ90 RNU6-1161P-201ENST00000516176 102 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
SPG7Q9UQ90 RNU6-724P-201ENST00000390958 105 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
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