Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
SCN8AQ9UQD0 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.663-201ENST00000516043 101 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
SCN8AQ9UQD0 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
SCN8AQ9UQD0 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
SCN8AQ9UQD0 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
SCN8AQ9UQD0 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
SCN8AQ9UQD0 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
SCN8AQ9UQD0 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
SCN8AQ9UQD0 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
SCN8AQ9UQD0 SNORD115-45-201ENST00000391078 81 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
SCN8AQ9UQD0 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.97
SCN8AQ9UQD0 RNU6-737P-201ENST00000365370 107 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
SCN8AQ9UQD0 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
SCN8AQ9UQD0 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
SCN8AQ9UQD0 MIR124-1-201ENST00000385275 85 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.520-201ENST00000384556 102 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
SCN8AQ9UQD0 RNU6-665P-201ENST00000384639 107 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
SCN8AQ9UQD0 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
SCN8AQ9UQD0 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.137-201ENST00000363455 112 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
SCN8AQ9UQD0 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
SCN8AQ9UQD0 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
SCN8AQ9UQD0 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
SCN8AQ9UQD0 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1161P-201ENST00000516176 102 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
SCN8AQ9UQD0 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
SCN8AQ9UQD0 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
SCN8AQ9UQD0 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC-3.6□□□□□ -2.99
SCN8AQ9UQD0 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
SCN8AQ9UQD0 MIR656-201ENST00000385224 78 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
SCN8AQ9UQD0 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
SCN8AQ9UQD0 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
SCN8AQ9UQD0 RNU6-854P-201ENST00000364036 107 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
SCN8AQ9UQD0 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
SCN8AQ9UQD0 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
SCN8AQ9UQD0 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
SCN8AQ9UQD0 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
SCN8AQ9UQD0 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
SCN8AQ9UQD0 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
SCN8AQ9UQD0 RNY4P13-201ENST00000384284 96 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
SCN8AQ9UQD0 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
SCN8AQ9UQD0 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
SCN8AQ9UQD0 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
SCN8AQ9UQD0 MIR548AH-201ENST00000637109 76 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
SCN8AQ9UQD0 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-3.72□□□□□ -3
SCN8AQ9UQD0 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC-3.72□□□□□ -3
SCN8AQ9UQD0 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-3.72□□□□□ -3
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-3.72□□□□□ -3.01
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1340P-201ENST00000384438 107 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
SCN8AQ9UQD0 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
SCN8AQ9UQD0 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
SCN8AQ9UQD0 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
SCN8AQ9UQD0 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
SCN8AQ9UQD0 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
SCN8AQ9UQD0 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
SCN8AQ9UQD0 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
SCN8AQ9UQD0 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
SCN8AQ9UQD0 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
SCN8AQ9UQD0 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
SCN8AQ9UQD0 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
SCN8AQ9UQD0 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.02
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1128P-201ENST00000362825 109 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
SCN8AQ9UQD0 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
SCN8AQ9UQD0 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
SCN8AQ9UQD0 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-3.8□□□□□ -3.02
SCN8AQ9UQD0 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
SCN8AQ9UQD0 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-3.83□□□□□ -3.02
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
SCN8AQ9UQD0 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-3.87□□□□□ -3.03
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-3.87□□□□□ -3.03
SCN8AQ9UQD0 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC-3.87□□□□□ -3.03
SCN8AQ9UQD0 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC-3.87□□□□□ -3.03
SCN8AQ9UQD0 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC-3.87□□□□□ -3.03
SCN8AQ9UQD0 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
SCN8AQ9UQD0 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
SCN8AQ9UQD0 MIR363-201ENST00000384840 75 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.03
SCN8AQ9UQD0 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.03
SCN8AQ9UQD0 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.04
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