Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
RABGEF1Q9UJ41 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
RABGEF1Q9UJ41 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
RABGEF1Q9UJ41 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
RABGEF1Q9UJ41 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
RABGEF1Q9UJ41 MIR656-201ENST00000385224 78 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
RABGEF1Q9UJ41 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
RABGEF1Q9UJ41 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
RABGEF1Q9UJ41 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
RABGEF1Q9UJ41 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
RABGEF1Q9UJ41 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
RABGEF1Q9UJ41 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
RABGEF1Q9UJ41 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
RABGEF1Q9UJ41 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
RABGEF1Q9UJ41 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
RABGEF1Q9UJ41 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
RABGEF1Q9UJ41 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
RABGEF1Q9UJ41 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
RABGEF1Q9UJ41 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
RABGEF1Q9UJ41 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
RABGEF1Q9UJ41 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
RABGEF1Q9UJ41 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
RABGEF1Q9UJ41 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1340P-201ENST00000384438 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
RABGEF1Q9UJ41 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
RABGEF1Q9UJ41 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
RABGEF1Q9UJ41 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
RABGEF1Q9UJ41 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
RABGEF1Q9UJ41 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
RABGEF1Q9UJ41 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
RABGEF1Q9UJ41 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
RABGEF1Q9UJ41 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
RABGEF1Q9UJ41 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RABGEF1Q9UJ41 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RABGEF1Q9UJ41 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RABGEF1Q9UJ41 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RABGEF1Q9UJ41 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RABGEF1Q9UJ41 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RABGEF1Q9UJ41 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RABGEF1Q9UJ41 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
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RABGEF1Q9UJ41 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
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RABGEF1Q9UJ41 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
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RABGEF1Q9UJ41 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
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RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
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RABGEF1Q9UJ41 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
RABGEF1Q9UJ41 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
RABGEF1Q9UJ41 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-854P-201ENST00000364036 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
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RABGEF1Q9UJ41 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
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