Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
CHCHD4Q8N4Q1 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
CHCHD4Q8N4Q1 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
CHCHD4Q8N4Q1 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
CHCHD4Q8N4Q1 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
CHCHD4Q8N4Q1 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
CHCHD4Q8N4Q1 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
CHCHD4Q8N4Q1 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
CHCHD4Q8N4Q1 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
CHCHD4Q8N4Q1 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
CHCHD4Q8N4Q1 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
CHCHD4Q8N4Q1 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
CHCHD4Q8N4Q1 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-1.86□□□□□ -2.71
CHCHD4Q8N4Q1 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
CHCHD4Q8N4Q1 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
CHCHD4Q8N4Q1 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
CHCHD4Q8N4Q1 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
CHCHD4Q8N4Q1 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-1.91□□□□□ -2.72
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
CHCHD4Q8N4Q1 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
CHCHD4Q8N4Q1 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
CHCHD4Q8N4Q1 MIR5693-201ENST00000577722 73 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
CHCHD4Q8N4Q1 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
CHCHD4Q8N4Q1 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
CHCHD4Q8N4Q1 AL731768.1-201ENST00000603124 139 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.79-201ENST00000362992 113 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
CHCHD4Q8N4Q1 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
CHCHD4Q8N4Q1 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
CHCHD4Q8N4Q1 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
CHCHD4Q8N4Q1 RNY4P25-201ENST00000459254 96 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
CHCHD4Q8N4Q1 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
CHCHD4Q8N4Q1 MIRLET7A3-201ENST00000362116 74 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-737P-201ENST00000365370 107 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
CHCHD4Q8N4Q1 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
CHCHD4Q8N4Q1 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
CHCHD4Q8N4Q1 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-854P-201ENST00000364036 107 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.2 ms