Protein–RNA interactions for Protein: Q6SPF0

SAMD1, Atherin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD1Q6SPF0 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SAMD1Q6SPF0 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SAMD1Q6SPF0 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SAMD1Q6SPF0 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SAMD1Q6SPF0 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SAMD1Q6SPF0 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SAMD1Q6SPF0 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SAMD1Q6SPF0 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SAMD1Q6SPF0 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SAMD1Q6SPF0 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
SAMD1Q6SPF0 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SAMD1Q6SPF0 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SAMD1Q6SPF0 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SAMD1Q6SPF0 RNU6-1340P-201ENST00000384438 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SAMD1Q6SPF0 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SAMD1Q6SPF0 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SAMD1Q6SPF0 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SAMD1Q6SPF0 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SAMD1Q6SPF0 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SAMD1Q6SPF0 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SAMD1Q6SPF0 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SAMD1Q6SPF0 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SAMD1Q6SPF0 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SAMD1Q6SPF0 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SAMD1Q6SPF0 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SAMD1Q6SPF0 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SAMD1Q6SPF0 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SAMD1Q6SPF0 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SAMD1Q6SPF0 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SAMD1Q6SPF0 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SAMD1Q6SPF0 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SAMD1Q6SPF0 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SAMD1Q6SPF0 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SAMD1Q6SPF0 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SAMD1Q6SPF0 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SAMD1Q6SPF0 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SAMD1Q6SPF0 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SAMD1Q6SPF0 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SAMD1Q6SPF0 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SAMD1Q6SPF0 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SAMD1Q6SPF0 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SAMD1Q6SPF0 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SAMD1Q6SPF0 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SAMD1Q6SPF0 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SAMD1Q6SPF0 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SAMD1Q6SPF0 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SAMD1Q6SPF0 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
SAMD1Q6SPF0 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SAMD1Q6SPF0 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SAMD1Q6SPF0 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SAMD1Q6SPF0 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SAMD1Q6SPF0 RNU6-620P-201ENST00000384017 96 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SAMD1Q6SPF0 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SAMD1Q6SPF0 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SAMD1Q6SPF0 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SAMD1Q6SPF0 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SAMD1Q6SPF0 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SAMD1Q6SPF0 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SAMD1Q6SPF0 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SAMD1Q6SPF0 RNU6-1024P-201ENST00000384199 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SAMD1Q6SPF0 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SAMD1Q6SPF0 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SAMD1Q6SPF0 RNU6-422P-201ENST00000384632 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SAMD1Q6SPF0 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SAMD1Q6SPF0 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SAMD1Q6SPF0 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SAMD1Q6SPF0 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SAMD1Q6SPF0 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SAMD1Q6SPF0 RNU6-854P-201ENST00000364036 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SAMD1Q6SPF0 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SAMD1Q6SPF0 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SAMD1Q6SPF0 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SAMD1Q6SPF0 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SAMD1Q6SPF0 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SAMD1Q6SPF0 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SAMD1Q6SPF0 RNU6-1043P-201ENST00000410355 99 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SAMD1Q6SPF0 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SAMD1Q6SPF0 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SAMD1Q6SPF0 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SAMD1Q6SPF0 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SAMD1Q6SPF0 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SAMD1Q6SPF0 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SAMD1Q6SPF0 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SAMD1Q6SPF0 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SAMD1Q6SPF0 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SAMD1Q6SPF0 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SAMD1Q6SPF0 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SAMD1Q6SPF0 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SAMD1Q6SPF0 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SAMD1Q6SPF0 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SAMD1Q6SPF0 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SAMD1Q6SPF0 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SAMD1Q6SPF0 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SAMD1Q6SPF0 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SAMD1Q6SPF0 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SAMD1Q6SPF0 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SAMD1Q6SPF0 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SAMD1Q6SPF0 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SAMD1Q6SPF0 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SAMD1Q6SPF0 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 203.1 ms