Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ANKRD39Q53RE8 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ANKRD39Q53RE8 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ANKRD39Q53RE8 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ANKRD39Q53RE8 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ANKRD39Q53RE8 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ANKRD39Q53RE8 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ANKRD39Q53RE8 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ANKRD39Q53RE8 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ANKRD39Q53RE8 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ANKRD39Q53RE8 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
ANKRD39Q53RE8 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ANKRD39Q53RE8 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ANKRD39Q53RE8 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ANKRD39Q53RE8 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ANKRD39Q53RE8 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ANKRD39Q53RE8 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ANKRD39Q53RE8 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ANKRD39Q53RE8 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ANKRD39Q53RE8 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ANKRD39Q53RE8 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ANKRD39Q53RE8 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ANKRD39Q53RE8 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
ANKRD39Q53RE8 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ANKRD39Q53RE8 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ANKRD39Q53RE8 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ANKRD39Q53RE8 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
ANKRD39Q53RE8 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ANKRD39Q53RE8 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
ANKRD39Q53RE8 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
ANKRD39Q53RE8 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
ANKRD39Q53RE8 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
ANKRD39Q53RE8 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
ANKRD39Q53RE8 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
ANKRD39Q53RE8 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
ANKRD39Q53RE8 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
ANKRD39Q53RE8 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
ANKRD39Q53RE8 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
ANKRD39Q53RE8 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
ANKRD39Q53RE8 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
ANKRD39Q53RE8 RNU6-59P-201ENST00000384787 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
ANKRD39Q53RE8 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
ANKRD39Q53RE8 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
ANKRD39Q53RE8 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ANKRD39Q53RE8 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ANKRD39Q53RE8 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ANKRD39Q53RE8 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ANKRD39Q53RE8 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ANKRD39Q53RE8 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ANKRD39Q53RE8 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ANKRD39Q53RE8 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
ANKRD39Q53RE8 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
ANKRD39Q53RE8 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
ANKRD39Q53RE8 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
ANKRD39Q53RE8 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
ANKRD39Q53RE8 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-1.76□□□□□ -2.69
ANKRD39Q53RE8 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
ANKRD39Q53RE8 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
ANKRD39Q53RE8 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
ANKRD39Q53RE8 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184 ms