Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMN1Q16637 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMN1Q16637 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMN1Q16637 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMN1Q16637 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMN1Q16637 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMN1Q16637 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SMN1Q16637 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SMN1Q16637 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMN1Q16637 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMN1Q16637 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMN1Q16637 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMN1Q16637 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMN1Q16637 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMN1Q16637 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMN1Q16637 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMN1Q16637 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMN1Q16637 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMN1Q16637 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMN1Q16637 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMN1Q16637 RNU6-1340P-201ENST00000384438 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SMN1Q16637 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMN1Q16637 RNU6-854P-201ENST00000364036 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMN1Q16637 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMN1Q16637 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMN1Q16637 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMN1Q16637 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SMN1Q16637 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SMN1Q16637 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SMN1Q16637 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SMN1Q16637 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMN1Q16637 RNU6-1024P-201ENST00000384199 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMN1Q16637 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SMN1Q16637 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMN1Q16637 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMN1Q16637 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMN1Q16637 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMN1Q16637 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMN1Q16637 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SMN1Q16637 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SMN1Q16637 RNU6-620P-201ENST00000384017 96 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SMN1Q16637 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SMN1Q16637 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SMN1Q16637 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SMN1Q16637 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SMN1Q16637 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SMN1Q16637 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SMN1Q16637 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SMN1Q16637 RNU6-1043P-201ENST00000410355 99 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SMN1Q16637 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SMN1Q16637 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SMN1Q16637 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SMN1Q16637 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SMN1Q16637 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SMN1Q16637 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SMN1Q16637 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SMN1Q16637 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SMN1Q16637 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SMN1Q16637 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SMN1Q16637 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SMN1Q16637 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SMN1Q16637 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SMN1Q16637 RNU6-422P-201ENST00000384632 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SMN1Q16637 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SMN1Q16637 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SMN1Q16637 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SMN1Q16637 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SMN1Q16637 MIR124-1-201ENST00000385275 85 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SMN1Q16637 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SMN1Q16637 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SMN1Q16637 RNU6-737P-201ENST00000365370 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMN1Q16637 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMN1Q16637 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMN1Q16637 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMN1Q16637 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SMN1Q16637 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SMN1Q16637 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SMN1Q16637 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMN1Q16637 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMN1Q16637 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SMN1Q16637 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SMN1Q16637 MIR548AH-201ENST00000637109 76 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SMN1Q16637 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SMN1Q16637 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SMN1Q16637 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SMN1Q16637 RNU6-1161P-201ENST00000516176 102 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SMN1Q16637 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SMN1Q16637 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SMN1Q16637 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMN1Q16637 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SMN1Q16637 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SMN1Q16637 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
SMN1Q16637 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SMN1Q16637 AL731768.1-201ENST00000603124 139 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SMN1Q16637 SNORD115-45-201ENST00000391078 81 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SMN1Q16637 Y_RNA.663-201ENST00000516043 101 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SMN1Q16637 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SMN1Q16637 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SMN1Q16637 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SMN1Q16637 RNU6-627P-201ENST00000364032 102 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
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