Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
TRAM1Q15629 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
TRAM1Q15629 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
TRAM1Q15629 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
TRAM1Q15629 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
TRAM1Q15629 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
TRAM1Q15629 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
TRAM1Q15629 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
TRAM1Q15629 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
TRAM1Q15629 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
TRAM1Q15629 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
TRAM1Q15629 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
TRAM1Q15629 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
TRAM1Q15629 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
TRAM1Q15629 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
TRAM1Q15629 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
TRAM1Q15629 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
TRAM1Q15629 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
TRAM1Q15629 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
TRAM1Q15629 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
TRAM1Q15629 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
TRAM1Q15629 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
TRAM1Q15629 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
TRAM1Q15629 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
TRAM1Q15629 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
TRAM1Q15629 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
TRAM1Q15629 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
TRAM1Q15629 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
TRAM1Q15629 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
TRAM1Q15629 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
TRAM1Q15629 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
TRAM1Q15629 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-3.72□□□□□ -3
TRAM1Q15629 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
TRAM1Q15629 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
TRAM1Q15629 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
TRAM1Q15629 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
TRAM1Q15629 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
TRAM1Q15629 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
TRAM1Q15629 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
TRAM1Q15629 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
TRAM1Q15629 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
TRAM1Q15629 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-3.8□□□□□ -3.02
TRAM1Q15629 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-3.8□□□□□ -3.02
TRAM1Q15629 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
TRAM1Q15629 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
TRAM1Q15629 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
TRAM1Q15629 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
TRAM1Q15629 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
TRAM1Q15629 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
TRAM1Q15629 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-3.85□□□□□ -3.03
TRAM1Q15629 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
TRAM1Q15629 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
TRAM1Q15629 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
TRAM1Q15629 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
TRAM1Q15629 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
TRAM1Q15629 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC-3.87□□□□□ -3.03
TRAM1Q15629 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
TRAM1Q15629 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
TRAM1Q15629 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
TRAM1Q15629 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
TRAM1Q15629 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
TRAM1Q15629 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
TRAM1Q15629 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
TRAM1Q15629 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
TRAM1Q15629 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
TRAM1Q15629 Y_RNA.511-201ENST00000384514 103 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.04
TRAM1Q15629 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
TRAM1Q15629 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
TRAM1Q15629 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
TRAM1Q15629 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
TRAM1Q15629 MIR5693-201ENST00000577722 73 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
TRAM1Q15629 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.04
TRAM1Q15629 AL731768.1-201ENST00000603124 139 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.04
TRAM1Q15629 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
TRAM1Q15629 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
TRAM1Q15629 RNY4P25-201ENST00000459254 96 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
TRAM1Q15629 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
TRAM1Q15629 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
TRAM1Q15629 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
TRAM1Q15629 Y_RNA.830-201ENST00000628531 96 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
TRAM1Q15629 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
TRAM1Q15629 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
TRAM1Q15629 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
TRAM1Q15629 MIR509-1-201ENST00000385265 94 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
TRAM1Q15629 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
TRAM1Q15629 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
TRAM1Q15629 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
TRAM1Q15629 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
TRAM1Q15629 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
TRAM1Q15629 Y_RNA.79-201ENST00000362992 113 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
TRAM1Q15629 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
TRAM1Q15629 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
TRAM1Q15629 RNA5SP106-201ENST00000517274 100 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
TRAM1Q15629 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
TRAM1Q15629 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
TRAM1Q15629 MIRLET7A3-201ENST00000362116 74 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
TRAM1Q15629 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
TRAM1Q15629 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
TRAM1Q15629 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
TRAM1Q15629 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms