Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SS18Q15532 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SS18Q15532 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SS18Q15532 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-1.11□□□□□ -2.59
SS18Q15532 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SS18Q15532 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SS18Q15532 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SS18Q15532 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SS18Q15532 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-1.12□□□□□ -2.59
SS18Q15532 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SS18Q15532 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SS18Q15532 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SS18Q15532 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SS18Q15532 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SS18Q15532 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SS18Q15532 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SS18Q15532 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SS18Q15532 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SS18Q15532 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SS18Q15532 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1.15□□□□□ -2.59
SS18Q15532 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SS18Q15532 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SS18Q15532 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SS18Q15532 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SS18Q15532 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SS18Q15532 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SS18Q15532 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SS18Q15532 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SS18Q15532 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SS18Q15532 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SS18Q15532 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SS18Q15532 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SS18Q15532 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SS18Q15532 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SS18Q15532 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SS18Q15532 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SS18Q15532 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SS18Q15532 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SS18Q15532 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SS18Q15532 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SS18Q15532 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SS18Q15532 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SS18Q15532 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SS18Q15532 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SS18Q15532 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SS18Q15532 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SS18Q15532 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SS18Q15532 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SS18Q15532 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SS18Q15532 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SS18Q15532 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SS18Q15532 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SS18Q15532 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SS18Q15532 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SS18Q15532 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SS18Q15532 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SS18Q15532 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SS18Q15532 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SS18Q15532 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SS18Q15532 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SS18Q15532 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SS18Q15532 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SS18Q15532 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SS18Q15532 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SS18Q15532 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SS18Q15532 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SS18Q15532 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SS18Q15532 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SS18Q15532 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SS18Q15532 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SS18Q15532 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SS18Q15532 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SS18Q15532 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SS18Q15532 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SS18Q15532 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SS18Q15532 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SS18Q15532 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SS18Q15532 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SS18Q15532 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SS18Q15532 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SS18Q15532 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SS18Q15532 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SS18Q15532 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SS18Q15532 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SS18Q15532 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SS18Q15532 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SS18Q15532 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SS18Q15532 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SS18Q15532 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SS18Q15532 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SS18Q15532 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SS18Q15532 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SS18Q15532 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SS18Q15532 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SS18Q15532 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SS18Q15532 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SS18Q15532 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SS18Q15532 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SS18Q15532 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SS18Q15532 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms