Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
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SNX17Q15036 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SNX17Q15036 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SNX17Q15036 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SNX17Q15036 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SNX17Q15036 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SNX17Q15036 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
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SNX17Q15036 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SNX17Q15036 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SNX17Q15036 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SNX17Q15036 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SNX17Q15036 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SNX17Q15036 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SNX17Q15036 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SNX17Q15036 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SNX17Q15036 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
SNX17Q15036 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SNX17Q15036 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
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SNX17Q15036 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SNX17Q15036 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SNX17Q15036 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SNX17Q15036 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SNX17Q15036 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SNX17Q15036 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SNX17Q15036 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SNX17Q15036 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SNX17Q15036 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SNX17Q15036 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SNX17Q15036 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SNX17Q15036 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SNX17Q15036 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SNX17Q15036 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SNX17Q15036 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SNX17Q15036 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
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SNX17Q15036 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
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SNX17Q15036 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
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SNX17Q15036 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
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SNX17Q15036 MIR656-201ENST00000385224 78 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
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SNX17Q15036 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SNX17Q15036 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SNX17Q15036 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SNX17Q15036 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SNX17Q15036 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SNX17Q15036 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SNX17Q15036 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SNX17Q15036 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SNX17Q15036 RNU6-1340P-201ENST00000384438 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SNX17Q15036 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
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