Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
XRCC4Q13426 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
XRCC4Q13426 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
XRCC4Q13426 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
XRCC4Q13426 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
XRCC4Q13426 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
XRCC4Q13426 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
XRCC4Q13426 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
XRCC4Q13426 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
XRCC4Q13426 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
XRCC4Q13426 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
XRCC4Q13426 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
XRCC4Q13426 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
XRCC4Q13426 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
XRCC4Q13426 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
XRCC4Q13426 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
XRCC4Q13426 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
XRCC4Q13426 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
XRCC4Q13426 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
XRCC4Q13426 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
XRCC4Q13426 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-3.15□□□□□ -2.91
XRCC4Q13426 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
XRCC4Q13426 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
XRCC4Q13426 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
XRCC4Q13426 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
XRCC4Q13426 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
XRCC4Q13426 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
XRCC4Q13426 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
XRCC4Q13426 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-3.17□□□□□ -2.92
XRCC4Q13426 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
XRCC4Q13426 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
XRCC4Q13426 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
XRCC4Q13426 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
XRCC4Q13426 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
XRCC4Q13426 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
XRCC4Q13426 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
XRCC4Q13426 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
XRCC4Q13426 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
XRCC4Q13426 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
XRCC4Q13426 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
XRCC4Q13426 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
XRCC4Q13426 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
XRCC4Q13426 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
XRCC4Q13426 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
XRCC4Q13426 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
XRCC4Q13426 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
XRCC4Q13426 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
XRCC4Q13426 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
XRCC4Q13426 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
XRCC4Q13426 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
XRCC4Q13426 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
XRCC4Q13426 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
XRCC4Q13426 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
XRCC4Q13426 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
XRCC4Q13426 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
XRCC4Q13426 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
XRCC4Q13426 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
XRCC4Q13426 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
XRCC4Q13426 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
XRCC4Q13426 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
XRCC4Q13426 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
XRCC4Q13426 AL731768.1-201ENST00000603124 139 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
XRCC4Q13426 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
XRCC4Q13426 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
XRCC4Q13426 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
XRCC4Q13426 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
XRCC4Q13426 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
XRCC4Q13426 MIR5693-201ENST00000577722 73 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
XRCC4Q13426 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
XRCC4Q13426 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
XRCC4Q13426 RNY4P25-201ENST00000459254 96 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
XRCC4Q13426 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
XRCC4Q13426 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
XRCC4Q13426 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
XRCC4Q13426 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
XRCC4Q13426 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
XRCC4Q13426 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
XRCC4Q13426 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
XRCC4Q13426 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
XRCC4Q13426 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
XRCC4Q13426 MIRLET7A3-201ENST00000362116 74 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
XRCC4Q13426 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
XRCC4Q13426 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
XRCC4Q13426 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
XRCC4Q13426 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
XRCC4Q13426 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
XRCC4Q13426 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
XRCC4Q13426 Y_RNA.79-201ENST00000362992 113 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
XRCC4Q13426 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
XRCC4Q13426 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
XRCC4Q13426 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
XRCC4Q13426 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
XRCC4Q13426 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
XRCC4Q13426 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
XRCC4Q13426 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
XRCC4Q13426 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
XRCC4Q13426 Y_RNA.612-201ENST00000410717 95 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
XRCC4Q13426 Y_RNA.830-201ENST00000628531 96 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
XRCC4Q13426 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
XRCC4Q13426 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
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