Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PTP4A2Q12974 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PTP4A2Q12974 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PTP4A2Q12974 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PTP4A2Q12974 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PTP4A2Q12974 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PTP4A2Q12974 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PTP4A2Q12974 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PTP4A2Q12974 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PTP4A2Q12974 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PTP4A2Q12974 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PTP4A2Q12974 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PTP4A2Q12974 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PTP4A2Q12974 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PTP4A2Q12974 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PTP4A2Q12974 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PTP4A2Q12974 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PTP4A2Q12974 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PTP4A2Q12974 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PTP4A2Q12974 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PTP4A2Q12974 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PTP4A2Q12974 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PTP4A2Q12974 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PTP4A2Q12974 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PTP4A2Q12974 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PTP4A2Q12974 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PTP4A2Q12974 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PTP4A2Q12974 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PTP4A2Q12974 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PTP4A2Q12974 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PTP4A2Q12974 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PTP4A2Q12974 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PTP4A2Q12974 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PTP4A2Q12974 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PTP4A2Q12974 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PTP4A2Q12974 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PTP4A2Q12974 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PTP4A2Q12974 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PTP4A2Q12974 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PTP4A2Q12974 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-1.58□□□□□ -2.66
PTP4A2Q12974 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PTP4A2Q12974 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PTP4A2Q12974 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PTP4A2Q12974 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PTP4A2Q12974 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PTP4A2Q12974 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PTP4A2Q12974 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PTP4A2Q12974 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PTP4A2Q12974 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PTP4A2Q12974 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PTP4A2Q12974 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-1.61□□□□□ -2.67
PTP4A2Q12974 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PTP4A2Q12974 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PTP4A2Q12974 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PTP4A2Q12974 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PTP4A2Q12974 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PTP4A2Q12974 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PTP4A2Q12974 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PTP4A2Q12974 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PTP4A2Q12974 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PTP4A2Q12974 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PTP4A2Q12974 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PTP4A2Q12974 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PTP4A2Q12974 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PTP4A2Q12974 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PTP4A2Q12974 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PTP4A2Q12974 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PTP4A2Q12974 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PTP4A2Q12974 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PTP4A2Q12974 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PTP4A2Q12974 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
PTP4A2Q12974 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
PTP4A2Q12974 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
PTP4A2Q12974 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PTP4A2Q12974 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1.68□□□□□ -2.68
PTP4A2Q12974 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PTP4A2Q12974 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PTP4A2Q12974 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PTP4A2Q12974 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
PTP4A2Q12974 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
PTP4A2Q12974 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
PTP4A2Q12974 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
PTP4A2Q12974 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
PTP4A2Q12974 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
PTP4A2Q12974 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
PTP4A2Q12974 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
PTP4A2Q12974 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
PTP4A2Q12974 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PTP4A2Q12974 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PTP4A2Q12974 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
PTP4A2Q12974 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
PTP4A2Q12974 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
PTP4A2Q12974 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
PTP4A2Q12974 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
PTP4A2Q12974 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
PTP4A2Q12974 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PTP4A2Q12974 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.82□□□□□ -2.7
PTP4A2Q12974 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
PTP4A2Q12974 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-1.85□□□□□ -2.71
PTP4A2Q12974 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
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