Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ATRXP46100 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ATRXP46100 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ATRXP46100 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATRXP46100 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATRXP46100 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATRXP46100 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATRXP46100 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATRXP46100 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATRXP46100 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATRXP46100 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATRXP46100 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATRXP46100 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ATRXP46100 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ATRXP46100 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ATRXP46100 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ATRXP46100 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ATRXP46100 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ATRXP46100 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATRXP46100 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATRXP46100 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATRXP46100 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATRXP46100 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATRXP46100 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATRXP46100 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ATRXP46100 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ATRXP46100 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATRXP46100 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATRXP46100 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATRXP46100 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATRXP46100 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ATRXP46100 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ATRXP46100 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
ATRXP46100 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATRXP46100 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATRXP46100 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATRXP46100 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATRXP46100 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATRXP46100 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATRXP46100 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATRXP46100 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATRXP46100 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATRXP46100 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATRXP46100 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATRXP46100 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATRXP46100 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATRXP46100 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATRXP46100 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATRXP46100 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATRXP46100 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ATRXP46100 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ATRXP46100 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ATRXP46100 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ATRXP46100 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
ATRXP46100 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ATRXP46100 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ATRXP46100 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ATRXP46100 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ATRXP46100 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ATRXP46100 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ATRXP46100 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ATRXP46100 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATRXP46100 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATRXP46100 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATRXP46100 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ATRXP46100 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ATRXP46100 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ATRXP46100 Y_RNA.511-201ENST00000384514 103 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ATRXP46100 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ATRXP46100 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATRXP46100 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATRXP46100 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATRXP46100 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATRXP46100 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATRXP46100 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ATRXP46100 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ATRXP46100 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ATRXP46100 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ATRXP46100 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ATRXP46100 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ATRXP46100 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATRXP46100 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATRXP46100 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ATRXP46100 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ATRXP46100 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ATRXP46100 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ATRXP46100 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ATRXP46100 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ATRXP46100 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ATRXP46100 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ATRXP46100 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ATRXP46100 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ATRXP46100 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATRXP46100 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATRXP46100 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATRXP46100 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATRXP46100 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATRXP46100 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATRXP46100 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ATRXP46100 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms