Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
TM4SF1P30408 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
TM4SF1P30408 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
TM4SF1P30408 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
TM4SF1P30408 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
TM4SF1P30408 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
TM4SF1P30408 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
TM4SF1P30408 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
TM4SF1P30408 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
TM4SF1P30408 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
TM4SF1P30408 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
TM4SF1P30408 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
TM4SF1P30408 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
TM4SF1P30408 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
TM4SF1P30408 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
TM4SF1P30408 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
TM4SF1P30408 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
TM4SF1P30408 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
TM4SF1P30408 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
TM4SF1P30408 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
TM4SF1P30408 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
TM4SF1P30408 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
TM4SF1P30408 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
TM4SF1P30408 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
TM4SF1P30408 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
TM4SF1P30408 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
TM4SF1P30408 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
TM4SF1P30408 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
TM4SF1P30408 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
TM4SF1P30408 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
TM4SF1P30408 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
TM4SF1P30408 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
TM4SF1P30408 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
TM4SF1P30408 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
TM4SF1P30408 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
TM4SF1P30408 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
TM4SF1P30408 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
TM4SF1P30408 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
TM4SF1P30408 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
TM4SF1P30408 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
TM4SF1P30408 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
TM4SF1P30408 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
TM4SF1P30408 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
TM4SF1P30408 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
TM4SF1P30408 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
TM4SF1P30408 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
TM4SF1P30408 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
TM4SF1P30408 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
TM4SF1P30408 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
TM4SF1P30408 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
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TM4SF1P30408 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
TM4SF1P30408 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-2.71□□□□□ -2.84
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TM4SF1P30408 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
TM4SF1P30408 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
TM4SF1P30408 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-2.74□□□□□ -2.85
TM4SF1P30408 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
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TM4SF1P30408 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.76□□□□□ -2.85
TM4SF1P30408 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
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TM4SF1P30408 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
TM4SF1P30408 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
TM4SF1P30408 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
TM4SF1P30408 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
TM4SF1P30408 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
TM4SF1P30408 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
TM4SF1P30408 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
TM4SF1P30408 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
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TM4SF1P30408 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
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TM4SF1P30408 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
TM4SF1P30408 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
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TM4SF1P30408 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
TM4SF1P30408 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
TM4SF1P30408 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
TM4SF1P30408 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
TM4SF1P30408 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
TM4SF1P30408 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
TM4SF1P30408 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
TM4SF1P30408 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
TM4SF1P30408 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
TM4SF1P30408 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
TM4SF1P30408 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
TM4SF1P30408 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
TM4SF1P30408 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
TM4SF1P30408 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
TM4SF1P30408 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
TM4SF1P30408 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
TM4SF1P30408 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
TM4SF1P30408 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
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