Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
PTPRDP23468 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
PTPRDP23468 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
PTPRDP23468 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-3.07□□□□□ -2.9
PTPRDP23468 AL359920.1-201ENST00000618332 176 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
PTPRDP23468 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
PTPRDP23468 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
PTPRDP23468 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
PTPRDP23468 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
PTPRDP23468 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
PTPRDP23468 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
PTPRDP23468 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
PTPRDP23468 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
PTPRDP23468 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
PTPRDP23468 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
PTPRDP23468 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
PTPRDP23468 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
PTPRDP23468 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
PTPRDP23468 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
PTPRDP23468 Y_RNA.137-201ENST00000363455 112 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
PTPRDP23468 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
PTPRDP23468 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
PTPRDP23468 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
PTPRDP23468 RNU6-737P-201ENST00000365370 107 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
PTPRDP23468 Y_RNA.663-201ENST00000516043 101 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
PTPRDP23468 MIR656-201ENST00000385224 78 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
PTPRDP23468 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
PTPRDP23468 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
PTPRDP23468 Y_RNA.520-201ENST00000384556 102 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
PTPRDP23468 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
PTPRDP23468 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
PTPRDP23468 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
PTPRDP23468 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
PTPRDP23468 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
PTPRDP23468 RNU6-1340P-201ENST00000384438 107 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
PTPRDP23468 MIR124-1-201ENST00000385275 85 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
PTPRDP23468 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
PTPRDP23468 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
PTPRDP23468 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
PTPRDP23468 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
PTPRDP23468 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
PTPRDP23468 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-3.24□□□□□ -2.93
PTPRDP23468 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
PTPRDP23468 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
PTPRDP23468 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
PTPRDP23468 SNORD115-45-201ENST00000391078 81 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
PTPRDP23468 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
PTPRDP23468 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
PTPRDP23468 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
PTPRDP23468 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
PTPRDP23468 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
PTPRDP23468 RNU6-1161P-201ENST00000516176 102 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
PTPRDP23468 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
PTPRDP23468 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
PTPRDP23468 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
PTPRDP23468 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
PTPRDP23468 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
PTPRDP23468 RNU6-854P-201ENST00000364036 107 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
PTPRDP23468 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
PTPRDP23468 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
PTPRDP23468 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
PTPRDP23468 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
PTPRDP23468 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
PTPRDP23468 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
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PTPRDP23468 RNU6-836P-201ENST00000362920 107 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
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PTPRDP23468 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
PTPRDP23468 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
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PTPRDP23468 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
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PTPRDP23468 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
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PTPRDP23468 Y_RNA.335-201ENST00000365299 96 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
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PTPRDP23468 RNU6-1128P-201ENST00000362825 109 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
PTPRDP23468 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
PTPRDP23468 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
PTPRDP23468 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
PTPRDP23468 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
PTPRDP23468 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
PTPRDP23468 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-3.44□□□□□ -2.96
PTPRDP23468 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
PTPRDP23468 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
PTPRDP23468 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
PTPRDP23468 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
PTPRDP23468 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
PTPRDP23468 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
PTPRDP23468 MIR548AH-201ENST00000637109 76 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
PTPRDP23468 RNU6-422P-201ENST00000384632 107 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
PTPRDP23468 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
PTPRDP23468 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.97
PTPRDP23468 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
PTPRDP23468 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
PTPRDP23468 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
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