Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SMAPO00193 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SMAPO00193 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SMAPO00193 RNU6-1091P-201ENST00000363945 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SMAPO00193 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SMAPO00193 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMAPO00193 Y_RNA.335-201ENST00000365299 96 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMAPO00193 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMAPO00193 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SMAPO00193 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SMAPO00193 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMAPO00193 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMAPO00193 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMAPO00193 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMAPO00193 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMAPO00193 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SMAPO00193 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SMAPO00193 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SMAPO00193 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SMAPO00193 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SMAPO00193 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SMAPO00193 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SMAPO00193 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SMAPO00193 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SMAPO00193 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SMAPO00193 Y_RNA.406-201ENST00000383984 100 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SMAPO00193 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SMAPO00193 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SMAPO00193 MIR656-201ENST00000385224 78 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SMAPO00193 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SMAPO00193 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SMAPO00193 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SMAPO00193 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SMAPO00193 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SMAPO00193 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMAPO00193 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SMAPO00193 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SMAPO00193 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SMAPO00193 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SMAPO00193 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SMAPO00193 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMAPO00193 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMAPO00193 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SMAPO00193 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SMAPO00193 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SMAPO00193 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SMAPO00193 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMAPO00193 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMAPO00193 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMAPO00193 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SMAPO00193 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SMAPO00193 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SMAPO00193 MIR548T-201ENST00000408369 74 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SMAPO00193 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SMAPO00193 RNU6-1340P-201ENST00000384438 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SMAPO00193 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SMAPO00193 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SMAPO00193 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SMAPO00193 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SMAPO00193 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SMAPO00193 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SMAPO00193 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SMAPO00193 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SMAPO00193 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SMAPO00193 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SMAPO00193 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SMAPO00193 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SMAPO00193 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SMAPO00193 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SMAPO00193 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SMAPO00193 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SMAPO00193 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SMAPO00193 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SMAPO00193 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SMAPO00193 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SMAPO00193 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SMAPO00193 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SMAPO00193 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SMAPO00193 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SMAPO00193 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SMAPO00193 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SMAPO00193 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SMAPO00193 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SMAPO00193 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SMAPO00193 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SMAPO00193 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SMAPO00193 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SMAPO00193 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SMAPO00193 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SMAPO00193 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SMAPO00193 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SMAPO00193 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SMAPO00193 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SMAPO00193 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SMAPO00193 RNU6-854P-201ENST00000364036 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SMAPO00193 RNU6-1043P-201ENST00000410355 99 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SMAPO00193 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SMAPO00193 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SMAPO00193 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SMAPO00193 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.9 ms