Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
J3KRW8 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
J3KRW8 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
J3KRW8 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
J3KRW8 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
J3KRW8 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
J3KRW8 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
J3KRW8 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
J3KRW8 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
J3KRW8 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
J3KRW8 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
J3KRW8 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
J3KRW8 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
J3KRW8 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
J3KRW8 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
J3KRW8 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
J3KRW8 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
J3KRW8 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
J3KRW8 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
J3KRW8 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
J3KRW8 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
J3KRW8 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
J3KRW8 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
J3KRW8 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
J3KRW8 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
J3KRW8 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
J3KRW8 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
J3KRW8 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
J3KRW8 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
J3KRW8 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
J3KRW8 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
J3KRW8 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
J3KRW8 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
J3KRW8 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
J3KRW8 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-3.17□□□□□ -2.92
J3KRW8 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
J3KRW8 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
J3KRW8 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
J3KRW8 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
J3KRW8 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
J3KRW8 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
J3KRW8 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
J3KRW8 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
J3KRW8 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-3.26□□□□□ -2.93
J3KRW8 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
J3KRW8 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
J3KRW8 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
J3KRW8 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
J3KRW8 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-3.28□□□□□ -2.93
J3KRW8 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
J3KRW8 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
J3KRW8 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
J3KRW8 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
J3KRW8 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
J3KRW8 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
J3KRW8 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
J3KRW8 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
J3KRW8 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
J3KRW8 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
J3KRW8 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
J3KRW8 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
J3KRW8 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
J3KRW8 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
J3KRW8 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
J3KRW8 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-3.45□□□□□ -2.96
J3KRW8 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
J3KRW8 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
J3KRW8 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
J3KRW8 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
J3KRW8 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
J3KRW8 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
J3KRW8 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
J3KRW8 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
J3KRW8 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
J3KRW8 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
J3KRW8 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
J3KRW8 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
J3KRW8 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
J3KRW8 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
J3KRW8 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
J3KRW8 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
J3KRW8 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
J3KRW8 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
J3KRW8 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
J3KRW8 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
J3KRW8 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
J3KRW8 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
J3KRW8 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
J3KRW8 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
J3KRW8 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
J3KRW8 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
J3KRW8 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
J3KRW8 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
J3KRW8 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
J3KRW8 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
J3KRW8 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
J3KRW8 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
J3KRW8 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
J3KRW8 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
J3KRW8 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-3.72□□□□□ -3
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