Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
C9orf78Q9NZ63 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
C9orf78Q9NZ63 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-2.36□□□□□ -2.79
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
C9orf78Q9NZ63 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
C9orf78Q9NZ63 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
C9orf78Q9NZ63 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
C9orf78Q9NZ63 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
C9orf78Q9NZ63 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
C9orf78Q9NZ63 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
C9orf78Q9NZ63 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
C9orf78Q9NZ63 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
C9orf78Q9NZ63 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
C9orf78Q9NZ63 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
C9orf78Q9NZ63 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
C9orf78Q9NZ63 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
C9orf78Q9NZ63 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
C9orf78Q9NZ63 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
C9orf78Q9NZ63 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
C9orf78Q9NZ63 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
C9orf78Q9NZ63 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-2.42□□□□□ -2.8
C9orf78Q9NZ63 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
C9orf78Q9NZ63 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-2.42□□□□□ -2.8
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
C9orf78Q9NZ63 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
C9orf78Q9NZ63 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
C9orf78Q9NZ63 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
C9orf78Q9NZ63 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
C9orf78Q9NZ63 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
C9orf78Q9NZ63 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
C9orf78Q9NZ63 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
C9orf78Q9NZ63 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
C9orf78Q9NZ63 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
C9orf78Q9NZ63 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
C9orf78Q9NZ63 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
C9orf78Q9NZ63 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
C9orf78Q9NZ63 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
C9orf78Q9NZ63 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
C9orf78Q9NZ63 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
C9orf78Q9NZ63 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
C9orf78Q9NZ63 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
C9orf78Q9NZ63 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
C9orf78Q9NZ63 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
C9orf78Q9NZ63 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
C9orf78Q9NZ63 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
C9orf78Q9NZ63 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
C9orf78Q9NZ63 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
C9orf78Q9NZ63 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
C9orf78Q9NZ63 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
C9orf78Q9NZ63 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
C9orf78Q9NZ63 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
C9orf78Q9NZ63 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
C9orf78Q9NZ63 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
C9orf78Q9NZ63 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
C9orf78Q9NZ63 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
C9orf78Q9NZ63 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
C9orf78Q9NZ63 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-2.64□□□□□ -2.83
C9orf78Q9NZ63 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
C9orf78Q9NZ63 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-2.64□□□□□ -2.83
C9orf78Q9NZ63 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
C9orf78Q9NZ63 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
C9orf78Q9NZ63 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
C9orf78Q9NZ63 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
C9orf78Q9NZ63 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
C9orf78Q9NZ63 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
C9orf78Q9NZ63 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
C9orf78Q9NZ63 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
C9orf78Q9NZ63 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
C9orf78Q9NZ63 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
C9orf78Q9NZ63 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
C9orf78Q9NZ63 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
C9orf78Q9NZ63 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
C9orf78Q9NZ63 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
C9orf78Q9NZ63 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
C9orf78Q9NZ63 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
C9orf78Q9NZ63 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
C9orf78Q9NZ63 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
C9orf78Q9NZ63 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
C9orf78Q9NZ63 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.72□□□□□ -2.84
C9orf78Q9NZ63 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
C9orf78Q9NZ63 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
C9orf78Q9NZ63 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
C9orf78Q9NZ63 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
C9orf78Q9NZ63 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
C9orf78Q9NZ63 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176 ms