Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
LIN28AQ9H9Z2 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
LIN28AQ9H9Z2 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
LIN28AQ9H9Z2 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
LIN28AQ9H9Z2 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
LIN28AQ9H9Z2 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
LIN28AQ9H9Z2 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
LIN28AQ9H9Z2 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
LIN28AQ9H9Z2 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
LIN28AQ9H9Z2 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
LIN28AQ9H9Z2 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
LIN28AQ9H9Z2 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
LIN28AQ9H9Z2 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
LIN28AQ9H9Z2 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
LIN28AQ9H9Z2 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
LIN28AQ9H9Z2 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
LIN28AQ9H9Z2 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
LIN28AQ9H9Z2 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
LIN28AQ9H9Z2 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
LIN28AQ9H9Z2 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
LIN28AQ9H9Z2 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
LIN28AQ9H9Z2 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
LIN28AQ9H9Z2 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
LIN28AQ9H9Z2 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
LIN28AQ9H9Z2 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
LIN28AQ9H9Z2 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
LIN28AQ9H9Z2 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
LIN28AQ9H9Z2 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-2.73□□□□□ -2.85
LIN28AQ9H9Z2 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
LIN28AQ9H9Z2 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
LIN28AQ9H9Z2 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
LIN28AQ9H9Z2 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
LIN28AQ9H9Z2 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
LIN28AQ9H9Z2 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
LIN28AQ9H9Z2 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
LIN28AQ9H9Z2 MIR5693-201ENST00000577722 73 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
LIN28AQ9H9Z2 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
LIN28AQ9H9Z2 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
LIN28AQ9H9Z2 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
LIN28AQ9H9Z2 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
LIN28AQ9H9Z2 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
LIN28AQ9H9Z2 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
LIN28AQ9H9Z2 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
LIN28AQ9H9Z2 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
LIN28AQ9H9Z2 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
LIN28AQ9H9Z2 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
LIN28AQ9H9Z2 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
LIN28AQ9H9Z2 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
LIN28AQ9H9Z2 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
LIN28AQ9H9Z2 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
LIN28AQ9H9Z2 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
LIN28AQ9H9Z2 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
LIN28AQ9H9Z2 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
LIN28AQ9H9Z2 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-2.82□□□□□ -2.86
LIN28AQ9H9Z2 RNY4P25-201ENST00000459254 96 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
LIN28AQ9H9Z2 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
LIN28AQ9H9Z2 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
LIN28AQ9H9Z2 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
LIN28AQ9H9Z2 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
LIN28AQ9H9Z2 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
LIN28AQ9H9Z2 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
LIN28AQ9H9Z2 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
LIN28AQ9H9Z2 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
LIN28AQ9H9Z2 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
LIN28AQ9H9Z2 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
LIN28AQ9H9Z2 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
LIN28AQ9H9Z2 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
LIN28AQ9H9Z2 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
LIN28AQ9H9Z2 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
LIN28AQ9H9Z2 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
LIN28AQ9H9Z2 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
LIN28AQ9H9Z2 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
LIN28AQ9H9Z2 Y_RNA.830-201ENST00000628531 96 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
LIN28AQ9H9Z2 Y_RNA.79-201ENST00000362992 113 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
LIN28AQ9H9Z2 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
LIN28AQ9H9Z2 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
LIN28AQ9H9Z2 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
LIN28AQ9H9Z2 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
LIN28AQ9H9Z2 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
LIN28AQ9H9Z2 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
LIN28AQ9H9Z2 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
LIN28AQ9H9Z2 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
LIN28AQ9H9Z2 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
LIN28AQ9H9Z2 AL731768.1-201ENST00000603124 139 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
LIN28AQ9H9Z2 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
LIN28AQ9H9Z2 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
LIN28AQ9H9Z2 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
LIN28AQ9H9Z2 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
LIN28AQ9H9Z2 MIRLET7A3-201ENST00000362116 74 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
LIN28AQ9H9Z2 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
LIN28AQ9H9Z2 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
LIN28AQ9H9Z2 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
LIN28AQ9H9Z2 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
LIN28AQ9H9Z2 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
LIN28AQ9H9Z2 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
LIN28AQ9H9Z2 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
LIN28AQ9H9Z2 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
LIN28AQ9H9Z2 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
LIN28AQ9H9Z2 Y_RNA.266-201ENST00000364678 96 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
LIN28AQ9H9Z2 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 296.8 ms