Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
KCNS3Q9BQ31 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
KCNS3Q9BQ31 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
KCNS3Q9BQ31 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
KCNS3Q9BQ31 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
KCNS3Q9BQ31 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
KCNS3Q9BQ31 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
KCNS3Q9BQ31 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
KCNS3Q9BQ31 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
KCNS3Q9BQ31 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
KCNS3Q9BQ31 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
KCNS3Q9BQ31 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
KCNS3Q9BQ31 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
KCNS3Q9BQ31 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
KCNS3Q9BQ31 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
KCNS3Q9BQ31 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
KCNS3Q9BQ31 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
KCNS3Q9BQ31 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
KCNS3Q9BQ31 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
KCNS3Q9BQ31 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
KCNS3Q9BQ31 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
KCNS3Q9BQ31 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
KCNS3Q9BQ31 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
KCNS3Q9BQ31 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
KCNS3Q9BQ31 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
KCNS3Q9BQ31 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
KCNS3Q9BQ31 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
KCNS3Q9BQ31 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
KCNS3Q9BQ31 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
KCNS3Q9BQ31 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
KCNS3Q9BQ31 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
KCNS3Q9BQ31 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
KCNS3Q9BQ31 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
KCNS3Q9BQ31 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
KCNS3Q9BQ31 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-2.39□□□□□ -2.79
KCNS3Q9BQ31 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
KCNS3Q9BQ31 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
KCNS3Q9BQ31 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
KCNS3Q9BQ31 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
KCNS3Q9BQ31 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
KCNS3Q9BQ31 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
KCNS3Q9BQ31 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
KCNS3Q9BQ31 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
KCNS3Q9BQ31 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
KCNS3Q9BQ31 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
KCNS3Q9BQ31 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
KCNS3Q9BQ31 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
KCNS3Q9BQ31 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
KCNS3Q9BQ31 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
KCNS3Q9BQ31 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
KCNS3Q9BQ31 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
KCNS3Q9BQ31 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
KCNS3Q9BQ31 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
KCNS3Q9BQ31 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
KCNS3Q9BQ31 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
KCNS3Q9BQ31 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
KCNS3Q9BQ31 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
KCNS3Q9BQ31 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
KCNS3Q9BQ31 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
KCNS3Q9BQ31 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
KCNS3Q9BQ31 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-2.48□□□□□ -2.81
KCNS3Q9BQ31 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
KCNS3Q9BQ31 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
KCNS3Q9BQ31 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
KCNS3Q9BQ31 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
KCNS3Q9BQ31 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
KCNS3Q9BQ31 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
KCNS3Q9BQ31 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
KCNS3Q9BQ31 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-2.5□□□□□ -2.81
KCNS3Q9BQ31 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
KCNS3Q9BQ31 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
KCNS3Q9BQ31 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
KCNS3Q9BQ31 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
KCNS3Q9BQ31 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
KCNS3Q9BQ31 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
KCNS3Q9BQ31 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
KCNS3Q9BQ31 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
KCNS3Q9BQ31 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
KCNS3Q9BQ31 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
KCNS3Q9BQ31 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
KCNS3Q9BQ31 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
KCNS3Q9BQ31 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
KCNS3Q9BQ31 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
KCNS3Q9BQ31 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-2.54□□□□□ -2.82
KCNS3Q9BQ31 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
KCNS3Q9BQ31 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
KCNS3Q9BQ31 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
KCNS3Q9BQ31 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
KCNS3Q9BQ31 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
KCNS3Q9BQ31 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
KCNS3Q9BQ31 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
KCNS3Q9BQ31 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
KCNS3Q9BQ31 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
KCNS3Q9BQ31 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
KCNS3Q9BQ31 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
KCNS3Q9BQ31 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
KCNS3Q9BQ31 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
KCNS3Q9BQ31 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
KCNS3Q9BQ31 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
KCNS3Q9BQ31 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 252.4 ms