Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SFT2D3Q587I9 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SFT2D3Q587I9 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SFT2D3Q587I9 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SFT2D3Q587I9 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SFT2D3Q587I9 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SFT2D3Q587I9 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SFT2D3Q587I9 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SFT2D3Q587I9 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SFT2D3Q587I9 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SFT2D3Q587I9 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SFT2D3Q587I9 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SFT2D3Q587I9 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SFT2D3Q587I9 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SFT2D3Q587I9 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SFT2D3Q587I9 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SFT2D3Q587I9 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SFT2D3Q587I9 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SFT2D3Q587I9 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SFT2D3Q587I9 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SFT2D3Q587I9 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SFT2D3Q587I9 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-2.19□□□□□ -2.76
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SFT2D3Q587I9 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SFT2D3Q587I9 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
SFT2D3Q587I9 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SFT2D3Q587I9 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SFT2D3Q587I9 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SFT2D3Q587I9 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SFT2D3Q587I9 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SFT2D3Q587I9 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SFT2D3Q587I9 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SFT2D3Q587I9 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SFT2D3Q587I9 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SFT2D3Q587I9 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SFT2D3Q587I9 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-2.24□□□□□ -2.77
SFT2D3Q587I9 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SFT2D3Q587I9 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SFT2D3Q587I9 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SFT2D3Q587I9 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SFT2D3Q587I9 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SFT2D3Q587I9 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SFT2D3Q587I9 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SFT2D3Q587I9 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SFT2D3Q587I9 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SFT2D3Q587I9 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-2.27□□□□□ -2.77
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SFT2D3Q587I9 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SFT2D3Q587I9 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SFT2D3Q587I9 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
SFT2D3Q587I9 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
SFT2D3Q587I9 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
SFT2D3Q587I9 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
SFT2D3Q587I9 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
SFT2D3Q587I9 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
SFT2D3Q587I9 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-2.32□□□□□ -2.78
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
SFT2D3Q587I9 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
SFT2D3Q587I9 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
SFT2D3Q587I9 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
SFT2D3Q587I9 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
SFT2D3Q587I9 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
SFT2D3Q587I9 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
SFT2D3Q587I9 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
SFT2D3Q587I9 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
SFT2D3Q587I9 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
SFT2D3Q587I9 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
SFT2D3Q587I9 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
SFT2D3Q587I9 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
SFT2D3Q587I9 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
SFT2D3Q587I9 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
SFT2D3Q587I9 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
SFT2D3Q587I9 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
SFT2D3Q587I9 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
SFT2D3Q587I9 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
SFT2D3Q587I9 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
SFT2D3Q587I9 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
SFT2D3Q587I9 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SFT2D3Q587I9 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SFT2D3Q587I9 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SFT2D3Q587I9 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SFT2D3Q587I9 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SFT2D3Q587I9 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SFT2D3Q587I9 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SFT2D3Q587I9 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
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