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Protein–RNA interactions for Protein: Q16623
STX1A, Syntaxin-1A, human
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288 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
STX1A
Q16623
AC005520.4-201
ENST00000604337
90 nt
BASIC
-1.94
□□□□□ -2.72
STX1A
Q16623
Y_RNA.790-201
ENST00000614282
102 nt
BASIC
-1.94
□□□□□ -2.72
STX1A
Q16623
Y_RNA.782-201
ENST00000614695
102 nt
BASIC
-1.94
□□□□□ -2.72
STX1A
Q16623
AC013734.1-201
ENST00000619329
111 nt
BASIC
-1.94
□□□□□ -2.72
STX1A
Q16623
MIR494-201
ENST00000349529
81 nt
BASIC
-1.95
□□□□□ -2.72
STX1A
Q16623
MIR450A2-201
ENST00000385022
100 nt
BASIC
-1.96
□□□□□ -2.72
STX1A
Q16623
RNU6-153P-201
ENST00000364422
104 nt
BASIC
-1.97
□□□□□ -2.72
STX1A
Q16623
Y_RNA.694-201
ENST00000516677
117 nt
BASIC
-1.97
□□□□□ -2.72
STX1A
Q16623
Y_RNA.55-201
ENST00000362797
102 nt
BASIC
-1.98
□□□□□ -2.73
STX1A
Q16623
RNU6-1034P-201
ENST00000365335
101 nt
BASIC
-1.98
□□□□□ -2.73
STX1A
Q16623
RNU6-1276P-201
ENST00000365372
104 nt
BASIC
-1.98
□□□□□ -2.73
STX1A
Q16623
Y_RNA.375-201
ENST00000365625
101 nt
BASIC
-1.98
□□□□□ -2.73
STX1A
Q16623
Y_RNA.699-201
ENST00000516803
93 nt
BASIC
-1.98
□□□□□ -2.73
STX1A
Q16623
U2.22-201
ENST00000636441
106 nt
BASIC
-1.98
□□□□□ -2.73
STX1A
Q16623
RNU4-88P-201
ENST00000411220
86 nt
BASIC
-1.99
□□□□□ -2.73
STX1A
Q16623
RNU7-151P-201
ENST00000516930
53 nt
BASIC
-1.99
□□□□□ -2.73
STX1A
Q16623
MIR7978-201
ENST00000636158
59 nt
BASIC
-1.99
□□□□□ -2.73
STX1A
Q16623
Y_RNA.94-201
ENST00000363068
106 nt
BASIC
-2
□□□□□ -2.73
STX1A
Q16623
SNORA27.2-201
ENST00000363365
126 nt
BASIC
-2
□□□□□ -2.73
STX1A
Q16623
RNU6-294P-201
ENST00000364999
102 nt
BASIC
-2
□□□□□ -2.73
STX1A
Q16623
SNORD116-24-201
ENST00000384549
92 nt
BASIC
-2
□□□□□ -2.73
STX1A
Q16623
Y_RNA.616-201
ENST00000410835
95 nt
BASIC
-2
□□□□□ -2.73
STX1A
Q16623
RNU6ATAC17P-201
ENST00000516074
71 nt
BASIC
-2
□□□□□ -2.73
STX1A
Q16623
CR2-207
ENST00000640301
151 nt
TSL 1 (best)
BASIC
-2
□□□□□ -2.73
STX1A
Q16623
RNU6-669P-201
ENST00000365575
107 nt
BASIC
-2.01
□□□□□ -2.73
STX1A
Q16623
MIR125B1-201
ENST00000385236
88 nt
BASIC
-2.01
□□□□□ -2.73
STX1A
Q16623
RNU6ATAC32P-201
ENST00000516026
76 nt
BASIC
-2.01
□□□□□ -2.73
STX1A
Q16623
RNU6-980P-201
ENST00000516925
103 nt
BASIC
-2.01
□□□□□ -2.73
STX1A
Q16623
MIR4666B-201
ENST00000578142
81 nt
BASIC
-2.01
□□□□□ -2.73
STX1A
Q16623
SNORD19B.1-201
ENST00000630615
80 nt
BASIC
-2.01
□□□□□ -2.73
STX1A
Q16623
RNU6-247P-201
ENST00000362636
107 nt
BASIC
-2.02
□□□□□ -2.73
STX1A
Q16623
MIR548W-201
ENST00000581970
74 nt
BASIC
-2.02
□□□□□ -2.73
STX1A
Q16623
SNORD114-3-201
ENST00000364969
75 nt
BASIC
-2.03
□□□□□ -2.73
STX1A
Q16623
Y_RNA.543-201
ENST00000384649
107 nt
BASIC
-2.03
□□□□□ -2.73
STX1A
Q16623
RNU6-995P-201
ENST00000391244
107 nt
BASIC
-2.03
□□□□□ -2.73
STX1A
Q16623
SNORD115-31-201
ENST00000365318
82 nt
BASIC
-2.04
□□□□□ -2.74
STX1A
Q16623
MIR3134-201
ENST00000579433
74 nt
BASIC
-2.04
□□□□□ -2.74
STX1A
Q16623
Y_RNA.788-201
ENST00000622394
112 nt
BASIC
-2.04
□□□□□ -2.74
STX1A
Q16623
Y_RNA.284-201
ENST00000364806
102 nt
BASIC
-2.05
□□□□□ -2.74
STX1A
Q16623
RNU6-974P-201
ENST00000384099
108 nt
BASIC
-2.05
□□□□□ -2.74
STX1A
Q16623
SNORD63.2-201
ENST00000516303
64 nt
BASIC
-2.05
□□□□□ -2.74
STX1A
Q16623
RNU6-523P-201
ENST00000516304
54 nt
BASIC
-2.05
□□□□□ -2.74
STX1A
Q16623
Y_RNA.211-201
ENST00000364164
101 nt
BASIC
-2.06
□□□□□ -2.74
STX1A
Q16623
MIR579-201
ENST00000385221
98 nt
BASIC
-2.06
□□□□□ -2.74
STX1A
Q16623
RNY3P8-201
ENST00000411366
126 nt
BASIC
-2.06
□□□□□ -2.74
STX1A
Q16623
snoU13.10-201
ENST00000459301
103 nt
BASIC
-2.07
□□□□□ -2.74
STX1A
Q16623
RNU6-542P-201
ENST00000516405
103 nt
BASIC
-2.07
□□□□□ -2.74
STX1A
Q16623
RNU6-687P-201
ENST00000516443
89 nt
BASIC
-2.07
□□□□□ -2.74
STX1A
Q16623
AL078612.1-201
ENST00000533009
150 nt
TSL 5
BASIC
-2.07
□□□□□ -2.74
STX1A
Q16623
LINC01984-201
ENST00000583863
301 nt
TSL 3
BASIC
-2.07
□□□□□ -2.74
STX1A
Q16623
U6.97-201
ENST00000636904
101 nt
BASIC
-2.07
□□□□□ -2.74
STX1A
Q16623
Y_RNA.591-201
ENST00000410228
104 nt
BASIC
-2.08
□□□□□ -2.74
STX1A
Q16623
RNU6-172P-201
ENST00000411000
93 nt
BASIC
-2.08
□□□□□ -2.74
STX1A
Q16623
RNU6-820P-201
ENST00000384273
107 nt
BASIC
-2.09
□□□□□ -2.74
STX1A
Q16623
MIR581-201
ENST00000384895
96 nt
BASIC
-2.09
□□□□□ -2.74
STX1A
Q16623
RNA5SP405-201
ENST00000363059
114 nt
BASIC
-2.1
□□□□□ -2.75
STX1A
Q16623
RNU6-411P-201
ENST00000384451
107 nt
BASIC
-2.11
□□□□□ -2.75
STX1A
Q16623
hsa-mir-4773-1.1-201
ENST00000585225
78 nt
BASIC
-2.11
□□□□□ -2.75
STX1A
Q16623
RNY4P27-201
ENST00000363341
96 nt
BASIC
-2.12
□□□□□ -2.75
STX1A
Q16623
Y_RNA.369-201
ENST00000365568
117 nt
BASIC
-2.12
□□□□□ -2.75
STX1A
Q16623
MIR5582-201
ENST00000579697
68 nt
BASIC
-2.12
□□□□□ -2.75
STX1A
Q16623
MIR4723-201
ENST00000585070
81 nt
BASIC
-2.12
□□□□□ -2.75
STX1A
Q16623
RNU6-92P-201
ENST00000605893
104 nt
BASIC
-2.12
□□□□□ -2.75
STX1A
Q16623
RNU6-787P-201
ENST00000384032
107 nt
BASIC
-2.13
□□□□□ -2.75
STX1A
Q16623
Y_RNA.564-201
ENST00000384708
106 nt
BASIC
-2.13
□□□□□ -2.75
STX1A
Q16623
SNORD18C-201
ENST00000362704
69 nt
BASIC
-2.14
□□□□□ -2.75
STX1A
Q16623
Y_RNA.139-201
ENST00000363464
102 nt
BASIC
-2.14
□□□□□ -2.75
STX1A
Q16623
MIR4748-201
ENST00000578076
82 nt
BASIC
-2.15
□□□□□ -2.75
STX1A
Q16623
U7.4-201
ENST00000614961
63 nt
BASIC
-2.15
□□□□□ -2.75
STX1A
Q16623
TRAJ9-201
ENST00000390528
61 nt
APPRIS P1
BASIC
-2.16
□□□□□ -2.76
STX1A
Q16623
MIR1207-201
ENST00000408249
87 nt
BASIC
-2.16
□□□□□ -2.76
STX1A
Q16623
Y_RNA.225-201
ENST00000364326
97 nt
BASIC
-2.17
□□□□□ -2.76
STX1A
Q16623
Y_RNA.321-201
ENST00000365149
102 nt
BASIC
-2.17
□□□□□ -2.76
STX1A
Q16623
RNU7-160P-201
ENST00000516660
62 nt
BASIC
-2.17
□□□□□ -2.76
STX1A
Q16623
RNU6-194P-201
ENST00000363862
105 nt
BASIC
-2.18
□□□□□ -2.76
STX1A
Q16623
MIR548N-201
ENST00000408742
75 nt
BASIC
-2.18
□□□□□ -2.76
STX1A
Q16623
RNU6-1015P-201
ENST00000517121
99 nt
BASIC
-2.18
□□□□□ -2.76
STX1A
Q16623
Y_RNA.69-201
ENST00000362885
109 nt
BASIC
-2.19
□□□□□ -2.76
STX1A
Q16623
RNU6-520P-201
ENST00000384717
104 nt
BASIC
-2.19
□□□□□ -2.76
STX1A
Q16623
RNU6-118P-201
ENST00000516552
102 nt
BASIC
-2.19
□□□□□ -2.76
STX1A
Q16623
AC062037.1-201
ENST00000605302
128 nt
BASIC
-2.19
□□□□□ -2.76
STX1A
Q16623
AC097484.2-201
ENST00000509147
251 nt
BASIC
-2.21
□□□□□ -2.76
STX1A
Q16623
Y_RNA.81-201
ENST00000362997
102 nt
BASIC
-2.22
□□□□□ -2.76
STX1A
Q16623
MIR466-201
ENST00000580653
84 nt
BASIC
-2.22
□□□□□ -2.76
STX1A
Q16623
FTX_4.1-201
ENST00000616291
147 nt
BASIC
-2.22
□□□□□ -2.76
STX1A
Q16623
Y_RNA.443-201
ENST00000384135
111 nt
BASIC
-2.23
□□□□□ -2.77
STX1A
Q16623
MIR3139-201
ENST00000579145
76 nt
BASIC
-2.23
□□□□□ -2.77
STX1A
Q16623
MIR202-201
ENST00000362219
110 nt
BASIC
-2.24
□□□□□ -2.77
STX1A
Q16623
SNORD60.1-201
ENST00000362451
73 nt
BASIC
-2.24
□□□□□ -2.77
STX1A
Q16623
Y_RNA.349-201
ENST00000365406
102 nt
BASIC
-2.24
□□□□□ -2.77
STX1A
Q16623
RNU6-634P-201
ENST00000459134
106 nt
BASIC
-2.24
□□□□□ -2.77
STX1A
Q16623
RNU6-361P-201
ENST00000364454
107 nt
BASIC
-2.25
□□□□□ -2.77
STX1A
Q16623
RNU6-828P-201
ENST00000364876
107 nt
BASIC
-2.25
□□□□□ -2.77
STX1A
Q16623
SNORD60-201
ENST00000383903
83 nt
BASIC
-2.25
□□□□□ -2.77
STX1A
Q16623
RNU6-663P-201
ENST00000391105
106 nt
BASIC
-2.25
□□□□□ -2.77
STX1A
Q16623
RNU6-68P-201
ENST00000516576
104 nt
BASIC
-2.26
□□□□□ -2.77
STX1A
Q16623
MIR7110-201
ENST00000612638
86 nt
BASIC
-2.26
□□□□□ -2.77
STX1A
Q16623
Y_RNA.475-201
ENST00000384345
101 nt
BASIC
-2.27
□□□□□ -2.77
STX1A
Q16623
RNU6-649P-201
ENST00000384463
107 nt
BASIC
-2.27
□□□□□ -2.77
STX1A
Q16623
RNU6-810P-201
ENST00000364001
107 nt
BASIC
-2.28
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