Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
PTPRKQ15262 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
PTPRKQ15262 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
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PTPRKQ15262 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
PTPRKQ15262 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
PTPRKQ15262 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-2.09□□□□□ -2.74
PTPRKQ15262 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
PTPRKQ15262 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
PTPRKQ15262 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
PTPRKQ15262 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
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PTPRKQ15262 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
PTPRKQ15262 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
PTPRKQ15262 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
PTPRKQ15262 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
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PTPRKQ15262 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
PTPRKQ15262 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
PTPRKQ15262 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
PTPRKQ15262 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
PTPRKQ15262 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
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PTPRKQ15262 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
PTPRKQ15262 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-2.14□□□□□ -2.75
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PTPRKQ15262 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
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PTPRKQ15262 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
PTPRKQ15262 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-2.15□□□□□ -2.75
PTPRKQ15262 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
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PTPRKQ15262 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
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PTPRKQ15262 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
PTPRKQ15262 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
PTPRKQ15262 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
PTPRKQ15262 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
PTPRKQ15262 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
PTPRKQ15262 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
PTPRKQ15262 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
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