Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
CHD4Q14839 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
CHD4Q14839 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
CHD4Q14839 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
CHD4Q14839 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
CHD4Q14839 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CHD4Q14839 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CHD4Q14839 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CHD4Q14839 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CHD4Q14839 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CHD4Q14839 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
CHD4Q14839 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
CHD4Q14839 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CHD4Q14839 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CHD4Q14839 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
CHD4Q14839 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
CHD4Q14839 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
CHD4Q14839 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CHD4Q14839 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CHD4Q14839 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CHD4Q14839 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CHD4Q14839 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CHD4Q14839 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CHD4Q14839 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CHD4Q14839 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CHD4Q14839 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CHD4Q14839 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CHD4Q14839 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CHD4Q14839 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CHD4Q14839 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CHD4Q14839 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CHD4Q14839 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CHD4Q14839 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
CHD4Q14839 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CHD4Q14839 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CHD4Q14839 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CHD4Q14839 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CHD4Q14839 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CHD4Q14839 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CHD4Q14839 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CHD4Q14839 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CHD4Q14839 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CHD4Q14839 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CHD4Q14839 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CHD4Q14839 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CHD4Q14839 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.62
CHD4Q14839 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.62
CHD4Q14839 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CHD4Q14839 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CHD4Q14839 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
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CHD4Q14839 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
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CHD4Q14839 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CHD4Q14839 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CHD4Q14839 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
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CHD4Q14839 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
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CHD4Q14839 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
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CHD4Q14839 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CHD4Q14839 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
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CHD4Q14839 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
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CHD4Q14839 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
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CHD4Q14839 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
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CHD4Q14839 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CHD4Q14839 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CHD4Q14839 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CHD4Q14839 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CHD4Q14839 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CHD4Q14839 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CHD4Q14839 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CHD4Q14839 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CHD4Q14839 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CHD4Q14839 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CHD4Q14839 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CHD4Q14839 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CHD4Q14839 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CHD4Q14839 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CHD4Q14839 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
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