Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-1.35□□□□□ -2.63
PRPF4BQ13523 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PRPF4BQ13523 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-1.36□□□□□ -2.63
PRPF4BQ13523 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PRPF4BQ13523 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PRPF4BQ13523 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PRPF4BQ13523 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PRPF4BQ13523 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PRPF4BQ13523 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PRPF4BQ13523 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PRPF4BQ13523 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PRPF4BQ13523 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PRPF4BQ13523 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PRPF4BQ13523 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PRPF4BQ13523 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
PRPF4BQ13523 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
PRPF4BQ13523 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-1.41□□□□□ -2.64
PRPF4BQ13523 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
PRPF4BQ13523 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-1.41□□□□□ -2.64
PRPF4BQ13523 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PRPF4BQ13523 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PRPF4BQ13523 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PRPF4BQ13523 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PRPF4BQ13523 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PRPF4BQ13523 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PRPF4BQ13523 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PRPF4BQ13523 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PRPF4BQ13523 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PRPF4BQ13523 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PRPF4BQ13523 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PRPF4BQ13523 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PRPF4BQ13523 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PRPF4BQ13523 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PRPF4BQ13523 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PRPF4BQ13523 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PRPF4BQ13523 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PRPF4BQ13523 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PRPF4BQ13523 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PRPF4BQ13523 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PRPF4BQ13523 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PRPF4BQ13523 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PRPF4BQ13523 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PRPF4BQ13523 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PRPF4BQ13523 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PRPF4BQ13523 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PRPF4BQ13523 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PRPF4BQ13523 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PRPF4BQ13523 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PRPF4BQ13523 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PRPF4BQ13523 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PRPF4BQ13523 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PRPF4BQ13523 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PRPF4BQ13523 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PRPF4BQ13523 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PRPF4BQ13523 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PRPF4BQ13523 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PRPF4BQ13523 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PRPF4BQ13523 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PRPF4BQ13523 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PRPF4BQ13523 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PRPF4BQ13523 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PRPF4BQ13523 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PRPF4BQ13523 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PRPF4BQ13523 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PRPF4BQ13523 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PRPF4BQ13523 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PRPF4BQ13523 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PRPF4BQ13523 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PRPF4BQ13523 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PRPF4BQ13523 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PRPF4BQ13523 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PRPF4BQ13523 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PRPF4BQ13523 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PRPF4BQ13523 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-1.59□□□□□ -2.66
PRPF4BQ13523 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PRPF4BQ13523 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PRPF4BQ13523 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PRPF4BQ13523 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PRPF4BQ13523 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PRPF4BQ13523 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PRPF4BQ13523 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PRPF4BQ13523 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PRPF4BQ13523 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PRPF4BQ13523 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PRPF4BQ13523 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PRPF4BQ13523 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PRPF4BQ13523 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PRPF4BQ13523 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PRPF4BQ13523 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PRPF4BQ13523 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PRPF4BQ13523 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PRPF4BQ13523 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PRPF4BQ13523 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PRPF4BQ13523 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PRPF4BQ13523 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PRPF4BQ13523 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PRPF4BQ13523 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PRPF4BQ13523 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PRPF4BQ13523 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PRPF4BQ13523 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 217 ms