Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
GTF3C1Q12789 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
GTF3C1Q12789 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
GTF3C1Q12789 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
GTF3C1Q12789 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
GTF3C1Q12789 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
GTF3C1Q12789 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
GTF3C1Q12789 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
GTF3C1Q12789 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
GTF3C1Q12789 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
GTF3C1Q12789 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
GTF3C1Q12789 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
GTF3C1Q12789 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
GTF3C1Q12789 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
GTF3C1Q12789 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
GTF3C1Q12789 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
GTF3C1Q12789 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
GTF3C1Q12789 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
GTF3C1Q12789 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
GTF3C1Q12789 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
GTF3C1Q12789 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
GTF3C1Q12789 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
GTF3C1Q12789 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
GTF3C1Q12789 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
GTF3C1Q12789 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
GTF3C1Q12789 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
GTF3C1Q12789 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
GTF3C1Q12789 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
GTF3C1Q12789 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
GTF3C1Q12789 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-1.1□□□□□ -2.59
GTF3C1Q12789 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
GTF3C1Q12789 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
GTF3C1Q12789 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
GTF3C1Q12789 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
GTF3C1Q12789 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
GTF3C1Q12789 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
GTF3C1Q12789 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
GTF3C1Q12789 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
GTF3C1Q12789 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
GTF3C1Q12789 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
GTF3C1Q12789 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
GTF3C1Q12789 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
GTF3C1Q12789 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
GTF3C1Q12789 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
GTF3C1Q12789 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
GTF3C1Q12789 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
GTF3C1Q12789 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
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GTF3C1Q12789 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
GTF3C1Q12789 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
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GTF3C1Q12789 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
GTF3C1Q12789 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
GTF3C1Q12789 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
GTF3C1Q12789 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
GTF3C1Q12789 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
GTF3C1Q12789 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
GTF3C1Q12789 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
GTF3C1Q12789 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
GTF3C1Q12789 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
GTF3C1Q12789 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
GTF3C1Q12789 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
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GTF3C1Q12789 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
GTF3C1Q12789 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
GTF3C1Q12789 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
GTF3C1Q12789 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
GTF3C1Q12789 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
GTF3C1Q12789 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
GTF3C1Q12789 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
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