Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

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Length 548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ERFP50548 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ERFP50548 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ERFP50548 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ERFP50548 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ERFP50548 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ERFP50548 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ERFP50548 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ERFP50548 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ERFP50548 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ERFP50548 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ERFP50548 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ERFP50548 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ERFP50548 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ERFP50548 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ERFP50548 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ERFP50548 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ERFP50548 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ERFP50548 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ERFP50548 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ERFP50548 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ERFP50548 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ERFP50548 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ERFP50548 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ERFP50548 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ERFP50548 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ERFP50548 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ERFP50548 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ERFP50548 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ERFP50548 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ERFP50548 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ERFP50548 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ERFP50548 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ERFP50548 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ERFP50548 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ERFP50548 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ERFP50548 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ERFP50548 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ERFP50548 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ERFP50548 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ERFP50548 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ERFP50548 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ERFP50548 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ERFP50548 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ERFP50548 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ERFP50548 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ERFP50548 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ERFP50548 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ERFP50548 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ERFP50548 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ERFP50548 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ERFP50548 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ERFP50548 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ERFP50548 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ERFP50548 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1.22□□□□□ -2.6
ERFP50548 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ERFP50548 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ERFP50548 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ERFP50548 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ERFP50548 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ERFP50548 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ERFP50548 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ERFP50548 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ERFP50548 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ERFP50548 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ERFP50548 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ERFP50548 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ERFP50548 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ERFP50548 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ERFP50548 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ERFP50548 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ERFP50548 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ERFP50548 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ERFP50548 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ERFP50548 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ERFP50548 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ERFP50548 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ERFP50548 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ERFP50548 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ERFP50548 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ERFP50548 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-1.26□□□□□ -2.61
ERFP50548 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-1.26□□□□□ -2.61
ERFP50548 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ERFP50548 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ERFP50548 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ERFP50548 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ERFP50548 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ERFP50548 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ERFP50548 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-1.27□□□□□ -2.61
ERFP50548 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ERFP50548 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ERFP50548 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ERFP50548 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ERFP50548 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ERFP50548 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ERFP50548 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ERFP50548 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ERFP50548 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ERFP50548 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ERFP50548 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
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