Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
NPHP4O75161 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
NPHP4O75161 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-2.5□□□□□ -2.81
NPHP4O75161 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
NPHP4O75161 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
NPHP4O75161 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
NPHP4O75161 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
NPHP4O75161 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
NPHP4O75161 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
NPHP4O75161 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
NPHP4O75161 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
NPHP4O75161 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
NPHP4O75161 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
NPHP4O75161 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
NPHP4O75161 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
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NPHP4O75161 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
NPHP4O75161 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
NPHP4O75161 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
NPHP4O75161 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
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NPHP4O75161 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
NPHP4O75161 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
NPHP4O75161 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
NPHP4O75161 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
NPHP4O75161 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
NPHP4O75161 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
NPHP4O75161 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
NPHP4O75161 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
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NPHP4O75161 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
NPHP4O75161 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
NPHP4O75161 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
NPHP4O75161 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
NPHP4O75161 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
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NPHP4O75161 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-2.61□□□□□ -2.83
NPHP4O75161 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
NPHP4O75161 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
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NPHP4O75161 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
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NPHP4O75161 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
NPHP4O75161 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
NPHP4O75161 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
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