Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN9

TRAPPC13, Trafficking protein particle complex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
TRAPPC13A5PLN9 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
TRAPPC13A5PLN9 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
TRAPPC13A5PLN9 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
TRAPPC13A5PLN9 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
TRAPPC13A5PLN9 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-2.29□□□□□ -2.78
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
TRAPPC13A5PLN9 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
TRAPPC13A5PLN9 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
TRAPPC13A5PLN9 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
TRAPPC13A5PLN9 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
TRAPPC13A5PLN9 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
TRAPPC13A5PLN9 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
TRAPPC13A5PLN9 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
TRAPPC13A5PLN9 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
TRAPPC13A5PLN9 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
TRAPPC13A5PLN9 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
TRAPPC13A5PLN9 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
TRAPPC13A5PLN9 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
TRAPPC13A5PLN9 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
TRAPPC13A5PLN9 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
TRAPPC13A5PLN9 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
TRAPPC13A5PLN9 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
TRAPPC13A5PLN9 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.41□□□□□ -2.8
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
TRAPPC13A5PLN9 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-2.41□□□□□ -2.8
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
TRAPPC13A5PLN9 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
TRAPPC13A5PLN9 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
TRAPPC13A5PLN9 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
TRAPPC13A5PLN9 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
TRAPPC13A5PLN9 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
TRAPPC13A5PLN9 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
TRAPPC13A5PLN9 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
TRAPPC13A5PLN9 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
TRAPPC13A5PLN9 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
TRAPPC13A5PLN9 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
TRAPPC13A5PLN9 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
TRAPPC13A5PLN9 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
TRAPPC13A5PLN9 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
TRAPPC13A5PLN9 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
TRAPPC13A5PLN9 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
TRAPPC13A5PLN9 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.7 ms