Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HOXD1Q9GZZ0 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HOXD1Q9GZZ0 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HOXD1Q9GZZ0 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HOXD1Q9GZZ0 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
HOXD1Q9GZZ0 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
HOXD1Q9GZZ0 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
HOXD1Q9GZZ0 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
HOXD1Q9GZZ0 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HOXD1Q9GZZ0 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HOXD1Q9GZZ0 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HOXD1Q9GZZ0 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HOXD1Q9GZZ0 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HOXD1Q9GZZ0 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HOXD1Q9GZZ0 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HOXD1Q9GZZ0 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HOXD1Q9GZZ0 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HOXD1Q9GZZ0 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HOXD1Q9GZZ0 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HOXD1Q9GZZ0 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HOXD1Q9GZZ0 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HOXD1Q9GZZ0 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HOXD1Q9GZZ0 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HOXD1Q9GZZ0 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HOXD1Q9GZZ0 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HOXD1Q9GZZ0 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HOXD1Q9GZZ0 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
HOXD1Q9GZZ0 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
HOXD1Q9GZZ0 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
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HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
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HOXD1Q9GZZ0 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-0.93□□□□□ -2.56
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HOXD1Q9GZZ0 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
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HOXD1Q9GZZ0 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
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HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
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HOXD1Q9GZZ0 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
HOXD1Q9GZZ0 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
HOXD1Q9GZZ0 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
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HOXD1Q9GZZ0 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
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HOXD1Q9GZZ0 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
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