Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
SLC38A2Q96QD8 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SLC38A2Q96QD8 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SLC38A2Q96QD8 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SLC38A2Q96QD8 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SLC38A2Q96QD8 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SLC38A2Q96QD8 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SLC38A2Q96QD8 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SLC38A2Q96QD8 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SLC38A2Q96QD8 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SLC38A2Q96QD8 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SLC38A2Q96QD8 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SLC38A2Q96QD8 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SLC38A2Q96QD8 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SLC38A2Q96QD8 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-2.26□□□□□ -2.77
SLC38A2Q96QD8 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SLC38A2Q96QD8 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SLC38A2Q96QD8 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SLC38A2Q96QD8 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SLC38A2Q96QD8 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SLC38A2Q96QD8 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SLC38A2Q96QD8 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SLC38A2Q96QD8 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
SLC38A2Q96QD8 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
SLC38A2Q96QD8 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
SLC38A2Q96QD8 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
SLC38A2Q96QD8 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
SLC38A2Q96QD8 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
SLC38A2Q96QD8 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
SLC38A2Q96QD8 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
SLC38A2Q96QD8 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
SLC38A2Q96QD8 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
SLC38A2Q96QD8 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
SLC38A2Q96QD8 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
SLC38A2Q96QD8 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
SLC38A2Q96QD8 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
SLC38A2Q96QD8 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
SLC38A2Q96QD8 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
SLC38A2Q96QD8 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
SLC38A2Q96QD8 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
SLC38A2Q96QD8 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
SLC38A2Q96QD8 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
SLC38A2Q96QD8 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
SLC38A2Q96QD8 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
SLC38A2Q96QD8 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
SLC38A2Q96QD8 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
SLC38A2Q96QD8 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
SLC38A2Q96QD8 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
SLC38A2Q96QD8 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
SLC38A2Q96QD8 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
SLC38A2Q96QD8 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
SLC38A2Q96QD8 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
SLC38A2Q96QD8 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
SLC38A2Q96QD8 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
SLC38A2Q96QD8 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
SLC38A2Q96QD8 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
SLC38A2Q96QD8 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
SLC38A2Q96QD8 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
SLC38A2Q96QD8 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
SLC38A2Q96QD8 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
SLC38A2Q96QD8 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
SLC38A2Q96QD8 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SLC38A2Q96QD8 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SLC38A2Q96QD8 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SLC38A2Q96QD8 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SLC38A2Q96QD8 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SLC38A2Q96QD8 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SLC38A2Q96QD8 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SLC38A2Q96QD8 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SLC38A2Q96QD8 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SLC38A2Q96QD8 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SLC38A2Q96QD8 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SLC38A2Q96QD8 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SLC38A2Q96QD8 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SLC38A2Q96QD8 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SLC38A2Q96QD8 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SLC38A2Q96QD8 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SLC38A2Q96QD8 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SLC38A2Q96QD8 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SLC38A2Q96QD8 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SLC38A2Q96QD8 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SLC38A2Q96QD8 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
SLC38A2Q96QD8 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
SLC38A2Q96QD8 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
SLC38A2Q96QD8 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SLC38A2Q96QD8 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SLC38A2Q96QD8 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SLC38A2Q96QD8 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SLC38A2Q96QD8 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SLC38A2Q96QD8 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SLC38A2Q96QD8 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SLC38A2Q96QD8 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
SLC38A2Q96QD8 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
SLC38A2Q96QD8 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
SLC38A2Q96QD8 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
SLC38A2Q96QD8 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
SLC38A2Q96QD8 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
SLC38A2Q96QD8 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
SLC38A2Q96QD8 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-2.53□□□□□ -2.81
SLC38A2Q96QD8 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms