Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
FAM3DQ96BQ1 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
FAM3DQ96BQ1 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
FAM3DQ96BQ1 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
FAM3DQ96BQ1 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
FAM3DQ96BQ1 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
FAM3DQ96BQ1 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
FAM3DQ96BQ1 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
FAM3DQ96BQ1 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
FAM3DQ96BQ1 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
FAM3DQ96BQ1 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
FAM3DQ96BQ1 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
FAM3DQ96BQ1 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
FAM3DQ96BQ1 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
FAM3DQ96BQ1 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
FAM3DQ96BQ1 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
FAM3DQ96BQ1 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
FAM3DQ96BQ1 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
FAM3DQ96BQ1 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
FAM3DQ96BQ1 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
FAM3DQ96BQ1 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
FAM3DQ96BQ1 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
FAM3DQ96BQ1 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
FAM3DQ96BQ1 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
FAM3DQ96BQ1 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
FAM3DQ96BQ1 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
FAM3DQ96BQ1 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
FAM3DQ96BQ1 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
FAM3DQ96BQ1 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
FAM3DQ96BQ1 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
FAM3DQ96BQ1 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
FAM3DQ96BQ1 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
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FAM3DQ96BQ1 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
FAM3DQ96BQ1 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
FAM3DQ96BQ1 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
FAM3DQ96BQ1 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
FAM3DQ96BQ1 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
FAM3DQ96BQ1 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
FAM3DQ96BQ1 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
FAM3DQ96BQ1 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
FAM3DQ96BQ1 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
FAM3DQ96BQ1 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
FAM3DQ96BQ1 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
FAM3DQ96BQ1 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
FAM3DQ96BQ1 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
FAM3DQ96BQ1 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
FAM3DQ96BQ1 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
FAM3DQ96BQ1 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
FAM3DQ96BQ1 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
FAM3DQ96BQ1 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
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FAM3DQ96BQ1 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
FAM3DQ96BQ1 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
FAM3DQ96BQ1 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
FAM3DQ96BQ1 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
FAM3DQ96BQ1 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
FAM3DQ96BQ1 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
FAM3DQ96BQ1 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-2.09□□□□□ -2.74
FAM3DQ96BQ1 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
FAM3DQ96BQ1 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
FAM3DQ96BQ1 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
FAM3DQ96BQ1 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
FAM3DQ96BQ1 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
FAM3DQ96BQ1 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-2.11□□□□□ -2.75
FAM3DQ96BQ1 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
FAM3DQ96BQ1 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
FAM3DQ96BQ1 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
FAM3DQ96BQ1 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
FAM3DQ96BQ1 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
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