Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
E2F4Q16254 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
E2F4Q16254 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
E2F4Q16254 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
E2F4Q16254 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
E2F4Q16254 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
E2F4Q16254 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
E2F4Q16254 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
E2F4Q16254 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
E2F4Q16254 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
E2F4Q16254 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
E2F4Q16254 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
E2F4Q16254 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
E2F4Q16254 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
E2F4Q16254 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
E2F4Q16254 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
E2F4Q16254 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
E2F4Q16254 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
E2F4Q16254 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
E2F4Q16254 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
E2F4Q16254 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
E2F4Q16254 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
E2F4Q16254 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
E2F4Q16254 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
E2F4Q16254 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
E2F4Q16254 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
E2F4Q16254 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
E2F4Q16254 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
E2F4Q16254 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
E2F4Q16254 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
E2F4Q16254 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
E2F4Q16254 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
E2F4Q16254 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
E2F4Q16254 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
E2F4Q16254 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
E2F4Q16254 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
E2F4Q16254 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
E2F4Q16254 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
E2F4Q16254 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
E2F4Q16254 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
E2F4Q16254 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
E2F4Q16254 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
E2F4Q16254 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
E2F4Q16254 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
E2F4Q16254 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
E2F4Q16254 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
E2F4Q16254 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
E2F4Q16254 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.06□□□□□ -2.4
E2F4Q16254 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
E2F4Q16254 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
E2F4Q16254 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
E2F4Q16254 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
E2F4Q16254 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
E2F4Q16254 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
E2F4Q16254 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
E2F4Q16254 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
E2F4Q16254 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
E2F4Q16254 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
E2F4Q16254 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
E2F4Q16254 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
E2F4Q16254 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
E2F4Q16254 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
E2F4Q16254 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
E2F4Q16254 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
E2F4Q16254 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
E2F4Q16254 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
E2F4Q16254 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
E2F4Q16254 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
E2F4Q16254 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
E2F4Q16254 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
E2F4Q16254 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
E2F4Q16254 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
E2F4Q16254 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
E2F4Q16254 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
E2F4Q16254 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
E2F4Q16254 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
E2F4Q16254 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
E2F4Q16254 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
E2F4Q16254 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
E2F4Q16254 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
E2F4Q16254 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
E2F4Q16254 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
E2F4Q16254 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
E2F4Q16254 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
E2F4Q16254 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
E2F4Q16254 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
E2F4Q16254 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
E2F4Q16254 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
E2F4Q16254 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
E2F4Q16254 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
E2F4Q16254 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
E2F4Q16254 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
E2F4Q16254 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
E2F4Q16254 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
E2F4Q16254 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
E2F4Q16254 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
E2F4Q16254 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
E2F4Q16254 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
E2F4Q16254 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
E2F4Q16254 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
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