Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
TTF1Q15361 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
TTF1Q15361 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
TTF1Q15361 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-1.03□□□□□ -2.57
TTF1Q15361 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
TTF1Q15361 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
TTF1Q15361 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
TTF1Q15361 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TTF1Q15361 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TTF1Q15361 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TTF1Q15361 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
TTF1Q15361 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
TTF1Q15361 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
TTF1Q15361 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
TTF1Q15361 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
TTF1Q15361 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
TTF1Q15361 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
TTF1Q15361 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
TTF1Q15361 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
TTF1Q15361 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
TTF1Q15361 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
TTF1Q15361 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
TTF1Q15361 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
TTF1Q15361 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
TTF1Q15361 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
TTF1Q15361 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
TTF1Q15361 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-1.11□□□□□ -2.59
TTF1Q15361 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
TTF1Q15361 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
TTF1Q15361 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
TTF1Q15361 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
TTF1Q15361 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
TTF1Q15361 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
TTF1Q15361 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
TTF1Q15361 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
TTF1Q15361 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
TTF1Q15361 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
TTF1Q15361 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
TTF1Q15361 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
TTF1Q15361 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
TTF1Q15361 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
TTF1Q15361 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
TTF1Q15361 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
TTF1Q15361 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
TTF1Q15361 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-1.19□□□□□ -2.6
TTF1Q15361 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
TTF1Q15361 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
TTF1Q15361 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
TTF1Q15361 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TTF1Q15361 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TTF1Q15361 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TTF1Q15361 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TTF1Q15361 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TTF1Q15361 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TTF1Q15361 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TTF1Q15361 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TTF1Q15361 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TTF1Q15361 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TTF1Q15361 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TTF1Q15361 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TTF1Q15361 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TTF1Q15361 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TTF1Q15361 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TTF1Q15361 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TTF1Q15361 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TTF1Q15361 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TTF1Q15361 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TTF1Q15361 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TTF1Q15361 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TTF1Q15361 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TTF1Q15361 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
TTF1Q15361 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
TTF1Q15361 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
TTF1Q15361 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
TTF1Q15361 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
TTF1Q15361 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
TTF1Q15361 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
TTF1Q15361 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
TTF1Q15361 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
TTF1Q15361 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
TTF1Q15361 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
TTF1Q15361 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
TTF1Q15361 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
TTF1Q15361 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
TTF1Q15361 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
TTF1Q15361 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
TTF1Q15361 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
TTF1Q15361 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TTF1Q15361 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TTF1Q15361 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
TTF1Q15361 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
TTF1Q15361 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
TTF1Q15361 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
TTF1Q15361 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
TTF1Q15361 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
TTF1Q15361 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
TTF1Q15361 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
TTF1Q15361 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
TTF1Q15361 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
TTF1Q15361 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 200.8 ms