Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SSPNQ14714 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SSPNQ14714 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SSPNQ14714 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SSPNQ14714 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SSPNQ14714 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SSPNQ14714 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SSPNQ14714 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SSPNQ14714 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SSPNQ14714 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SSPNQ14714 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SSPNQ14714 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SSPNQ14714 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SSPNQ14714 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SSPNQ14714 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SSPNQ14714 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SSPNQ14714 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SSPNQ14714 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SSPNQ14714 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SSPNQ14714 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SSPNQ14714 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SSPNQ14714 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SSPNQ14714 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SSPNQ14714 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SSPNQ14714 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SSPNQ14714 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SSPNQ14714 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SSPNQ14714 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SSPNQ14714 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SSPNQ14714 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SSPNQ14714 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SSPNQ14714 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SSPNQ14714 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SSPNQ14714 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SSPNQ14714 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SSPNQ14714 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SSPNQ14714 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
SSPNQ14714 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SSPNQ14714 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SSPNQ14714 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SSPNQ14714 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SSPNQ14714 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SSPNQ14714 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SSPNQ14714 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SSPNQ14714 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SSPNQ14714 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SSPNQ14714 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SSPNQ14714 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SSPNQ14714 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SSPNQ14714 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SSPNQ14714 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SSPNQ14714 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SSPNQ14714 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SSPNQ14714 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SSPNQ14714 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SSPNQ14714 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SSPNQ14714 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SSPNQ14714 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SSPNQ14714 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SSPNQ14714 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SSPNQ14714 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SSPNQ14714 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SSPNQ14714 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SSPNQ14714 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SSPNQ14714 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SSPNQ14714 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SSPNQ14714 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SSPNQ14714 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SSPNQ14714 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SSPNQ14714 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SSPNQ14714 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SSPNQ14714 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SSPNQ14714 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SSPNQ14714 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SSPNQ14714 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SSPNQ14714 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SSPNQ14714 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SSPNQ14714 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SSPNQ14714 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SSPNQ14714 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SSPNQ14714 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SSPNQ14714 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SSPNQ14714 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SSPNQ14714 RNU6-59P-201ENST00000384787 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SSPNQ14714 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SSPNQ14714 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SSPNQ14714 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SSPNQ14714 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SSPNQ14714 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SSPNQ14714 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SSPNQ14714 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SSPNQ14714 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SSPNQ14714 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SSPNQ14714 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SSPNQ14714 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SSPNQ14714 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SSPNQ14714 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SSPNQ14714 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SSPNQ14714 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SSPNQ14714 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 253 ms