Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
TNFAIP1Q13829 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TNFAIP1Q13829 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TNFAIP1Q13829 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TNFAIP1Q13829 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TNFAIP1Q13829 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TNFAIP1Q13829 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
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TNFAIP1Q13829 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TNFAIP1Q13829 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TNFAIP1Q13829 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TNFAIP1Q13829 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TNFAIP1Q13829 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TNFAIP1Q13829 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TNFAIP1Q13829 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TNFAIP1Q13829 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TNFAIP1Q13829 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TNFAIP1Q13829 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TNFAIP1Q13829 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
TNFAIP1Q13829 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TNFAIP1Q13829 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TNFAIP1Q13829 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TNFAIP1Q13829 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TNFAIP1Q13829 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TNFAIP1Q13829 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TNFAIP1Q13829 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TNFAIP1Q13829 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TNFAIP1Q13829 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
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TNFAIP1Q13829 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
TNFAIP1Q13829 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
TNFAIP1Q13829 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
TNFAIP1Q13829 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
TNFAIP1Q13829 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
TNFAIP1Q13829 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
TNFAIP1Q13829 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
TNFAIP1Q13829 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
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TNFAIP1Q13829 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
TNFAIP1Q13829 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
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TNFAIP1Q13829 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
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TNFAIP1Q13829 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
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TNFAIP1Q13829 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
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TNFAIP1Q13829 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TNFAIP1Q13829 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TNFAIP1Q13829 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
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TNFAIP1Q13829 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
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TNFAIP1Q13829 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TNFAIP1Q13829 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
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TNFAIP1Q13829 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
TNFAIP1Q13829 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
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TNFAIP1Q13829 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
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TNFAIP1Q13829 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TNFAIP1Q13829 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
TNFAIP1Q13829 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TNFAIP1Q13829 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
TNFAIP1Q13829 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
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